More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1057 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  348  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  64.61 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  57.3 
 
 		 173 aa  188  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  47.12 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  50.32 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  42.02 
 
 		 192 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  44.51 
 
 		 202 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  41.88 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  41.62 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  45 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  41.76 
 
 		 196 aa  121  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  44.16 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  42.41 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  42.76 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  42.62 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  44.89 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  37.7 
 
 		 186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  41.53 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  38.12 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  38.12 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  43.24 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  41.53 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  51.91 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  41.08 
 
 		 185 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  41.3 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  43.96 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  35.71 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  36.26 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  36.81 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  38.8 
 
 		 186 aa  111  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  41.08 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  32.96 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.1 
 
 		 220 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.1 
 
 		 220 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  42.11 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.1 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.43 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  43.35 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  40 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  45.39 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  40.78 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.43 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  40.88 
 
 		 184 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  39.78 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  38.61 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  40 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  39.13 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  39.34 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  40.88 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  33.7 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  43.32 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  34.83 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  43.95 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  36.26 
 
 		 186 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  43.05 
 
 		 184 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.89 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  44.08 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  42.47 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  35 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  39.67 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  43.4 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  47.29 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  41.9 
 
 		 189 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  37.91 
 
 		 184 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  34.08 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  36.81 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  42 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.67 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.33 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  43.59 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.67 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  42.51 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.67 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.08 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.67 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  37.57 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  32.97 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.67 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  33.52 
 
 		 200 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  48.12 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  39.13 
 
 		 190 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  44.52 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  38.59 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  42.62 
 
 		 198 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  42.7 
 
 		 186 aa  100  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.31 
 
 		 202 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  40.13 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  40.88 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.33 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  33.7 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  35.29 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  35.29 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  40.13 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  39.33 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  43.56 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  37.02 
 
 		 208 aa  99.8  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.33 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  39.33 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  53.85 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>