More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2873 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  100 
 
 
191 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  61.75 
 
 
185 aa  217  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  62.37 
 
 
185 aa  202  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  56.76 
 
 
183 aa  200  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  57.46 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  57.84 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  54.1 
 
 
190 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  58.66 
 
 
187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  56.91 
 
 
188 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  54.59 
 
 
185 aa  191  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  56.91 
 
 
184 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  57.46 
 
 
188 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  55.68 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  50 
 
 
186 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  50.27 
 
 
187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  47.31 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  51.4 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  51.4 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  54.59 
 
 
184 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  50.28 
 
 
186 aa  170  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  50.26 
 
 
189 aa  168  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  53.51 
 
 
184 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  47.85 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  47.31 
 
 
186 aa  161  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  53.51 
 
 
184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  47.83 
 
 
187 aa  158  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  47.31 
 
 
185 aa  156  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  48.37 
 
 
185 aa  155  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  47.34 
 
 
184 aa  151  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  47.15 
 
 
198 aa  148  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  42.39 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  45.92 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  46.03 
 
 
184 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  45.5 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  44.32 
 
 
185 aa  131  6.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  45.74 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  43.39 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  36.56 
 
 
186 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  43.55 
 
 
185 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  43.55 
 
 
185 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  41.21 
 
 
189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  41.49 
 
 
188 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  39.46 
 
 
194 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  42.39 
 
 
187 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  41.85 
 
 
187 aa  121  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  40.88 
 
 
183 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  48.21 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  40.62 
 
 
193 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  38.3 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  45.13 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  40.72 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  39.57 
 
 
184 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  38.66 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  42.08 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  39.67 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  37.02 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  41.03 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  39.57 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  38.83 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  36.96 
 
 
188 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  34.97 
 
 
178 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  35.11 
 
 
187 aa  111  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  35.87 
 
 
188 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  39.89 
 
 
190 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  39.04 
 
 
187 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  35.87 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  36.07 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  35.33 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  35.33 
 
 
188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  40.64 
 
 
184 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  43.55 
 
 
185 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  40.22 
 
 
193 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  35.87 
 
 
188 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  40.11 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  37.89 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  38.54 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  38.59 
 
 
209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  40.24 
 
 
187 aa  108  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  43.23 
 
 
180 aa  108  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  35.71 
 
 
200 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  42.93 
 
 
188 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  29.44 
 
 
184 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  33.33 
 
 
210 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.85 
 
 
191 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  35.57 
 
 
194 aa  105  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  34.24 
 
 
188 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  34.24 
 
 
188 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  34.24 
 
 
188 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  34.24 
 
 
188 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  38.5 
 
 
192 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  34.24 
 
 
188 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0201  putative methyltransferase  31.41 
 
 
198 aa  104  7e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  34.43 
 
 
180 aa  104  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  36.02 
 
 
198 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  41.62 
 
 
184 aa  104  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  36.7 
 
 
185 aa  104  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  36.17 
 
 
185 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  38.17 
 
 
198 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.24 
 
 
191 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  41.71 
 
 
186 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>