More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4320 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  100 
 
 
184 aa  353  7.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  91.3 
 
 
184 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  90.76 
 
 
184 aa  300  8.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  68.48 
 
 
185 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  68.11 
 
 
185 aa  225  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  67.76 
 
 
185 aa  201  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  57.14 
 
 
184 aa  195  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  56.04 
 
 
184 aa  187  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  54.05 
 
 
186 aa  187  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  58.33 
 
 
183 aa  187  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  54.89 
 
 
185 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  53.55 
 
 
188 aa  185  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  55.19 
 
 
187 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  56.52 
 
 
184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  54.59 
 
 
191 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  55.03 
 
 
189 aa  180  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  54.64 
 
 
188 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  52.22 
 
 
186 aa  178  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  49.73 
 
 
190 aa  177  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  50.27 
 
 
186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  52.22 
 
 
186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  50 
 
 
187 aa  169  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  50 
 
 
187 aa  169  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  50 
 
 
187 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  50.82 
 
 
186 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  50.82 
 
 
185 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  47.59 
 
 
185 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  53.26 
 
 
184 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  53.26 
 
 
184 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  50.54 
 
 
198 aa  153  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  49.46 
 
 
184 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  47.57 
 
 
187 aa  148  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  50.82 
 
 
185 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  43.26 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  46.81 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  41.08 
 
 
188 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  44.92 
 
 
187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  43.17 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  43.78 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  44.81 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  38.92 
 
 
207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  43.23 
 
 
192 aa  122  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  47.88 
 
 
205 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  45.7 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  40 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  48.19 
 
 
197 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  42.86 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  41.76 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  41.76 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  41.27 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  32.43 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  41.08 
 
 
193 aa  117  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.55 
 
 
198 aa  117  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.55 
 
 
198 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.55 
 
 
198 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  45.71 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  34.05 
 
 
184 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  39.55 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  38.04 
 
 
190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.55 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  41.76 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.55 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.98 
 
 
198 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  45.45 
 
 
187 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  38.98 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  38.98 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  45.26 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  45.26 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  43.53 
 
 
198 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.83 
 
 
191 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  41.48 
 
 
200 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.83 
 
 
191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  44.44 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  39.89 
 
 
187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  36.07 
 
 
222 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  36.07 
 
 
222 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  36.07 
 
 
222 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  36.07 
 
 
221 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  47.5 
 
 
174 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  37.23 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  35.2 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  45.36 
 
 
173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  42.47 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.21 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  42.94 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  42.22 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.59 
 
 
207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  43.39 
 
 
193 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  36.07 
 
 
215 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.55 
 
 
207 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.59 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.59 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.59 
 
 
207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  38.8 
 
 
209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  38.89 
 
 
184 aa  111  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  37.5 
 
 
183 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  42.35 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  40 
 
 
202 aa  111  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  43.05 
 
 
180 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.85 
 
 
199 aa  110  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>