More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2034 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  51.63 
 
 		 190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  51.35 
 
 		 186 aa  175  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  48.68 
 
 		 190 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  48.63 
 
 		 189 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  49.18 
 
 		 186 aa  154  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  43.33 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  44.44 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  36.46 
 
 		 185 aa  130  6.999999999999999e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  47.27 
 
 		 183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  42.78 
 
 		 187 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  43.41 
 
 		 189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  44.77 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  43.64 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  38.12 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  43.64 
 
 		 184 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  44.44 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  37.85 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  44.09 
 
 		 185 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  43.89 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.56 
 
 		 191 aa  120  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  40.88 
 
 		 191 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.11 
 
 		 191 aa  120  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  42.05 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  40 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  39.2 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  39.25 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  40 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  40.57 
 
 		 215 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  37.29 
 
 		 180 aa  117  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  40.57 
 
 		 215 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  39.2 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  38.46 
 
 		 202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  40 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  43.24 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  39.64 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  40.57 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.8 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  39.55 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  40 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  42.42 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  40.57 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 		 202 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  37.64 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  37.64 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  38.2 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  44.74 
 
 		 188 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  42.29 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  41.98 
 
 		 222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  39.66 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  41.98 
 
 		 222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  42.46 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  37.21 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  41.98 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  38.86 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  43.65 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  36.52 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  40.86 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  37.99 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  37.63 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  38.86 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  38.07 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  36.46 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  42.78 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  34.25 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  35.91 
 
 		 200 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  32.68 
 
 		 183 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  39.66 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  39.34 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  36.46 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  39.89 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  41.94 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.36 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  35.36 
 
 		 200 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  37.22 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  40.78 
 
 		 209 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  37.02 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  37.02 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  35.36 
 
 		 200 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  42.39 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  41.18 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.29 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  36.36 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.29 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  40.13 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.42 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  40.32 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  46.05 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  43.75 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  34.81 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  32.46 
 
 		 184 aa  105  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  40.78 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  42.78 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  42.22 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  29.44 
 
 		 184 aa  103  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  38.64 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  34.78 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  38.38 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  38.38 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>