More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0395 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  100 
 
 
186 aa  371  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  55.43 
 
 
190 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  53.8 
 
 
186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  54.59 
 
 
190 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  50.82 
 
 
189 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  49.18 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.7 
 
 
191 aa  124  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  38.92 
 
 
178 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  38.5 
 
 
194 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.7 
 
 
191 aa  123  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  40.54 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  40 
 
 
197 aa  117  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  36.9 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  40.21 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  47.56 
 
 
183 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  40.21 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.45 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.45 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  39.46 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.45 
 
 
220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  39.46 
 
 
200 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  37.63 
 
 
202 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  37.1 
 
 
179 aa  114  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  40.66 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  32.45 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  36.41 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  40.66 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  39.46 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.25 
 
 
199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  37.23 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  38.3 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  41.71 
 
 
191 aa  112  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  39.25 
 
 
182 aa  111  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  35.14 
 
 
186 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  42.31 
 
 
193 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  41.72 
 
 
186 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  36.41 
 
 
186 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  39.23 
 
 
187 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  35.45 
 
 
178 aa  110  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  41.4 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  37.89 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  38.42 
 
 
194 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  32.97 
 
 
203 aa  108  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  36.56 
 
 
185 aa  109  3e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  36.32 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  37.37 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  33.86 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  36.76 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  39.15 
 
 
188 aa  108  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  35.29 
 
 
188 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.22 
 
 
198 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.3 
 
 
207 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  50 
 
 
193 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  38.71 
 
 
187 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  36.84 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  34.04 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  35.98 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  38.14 
 
 
186 aa  107  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  35.98 
 
 
178 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  40 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  38.38 
 
 
185 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  35.16 
 
 
205 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  36.6 
 
 
200 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  36.32 
 
 
185 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  37.85 
 
 
199 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  38.04 
 
 
188 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  45.86 
 
 
186 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.76 
 
 
206 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  51.59 
 
 
180 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  40.49 
 
 
185 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  35.48 
 
 
199 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.22 
 
 
198 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  35.45 
 
 
210 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  40.76 
 
 
191 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  35.26 
 
 
186 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  36.22 
 
 
198 aa  105  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.22 
 
 
198 aa  105  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  105  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.22 
 
 
198 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.22 
 
 
198 aa  105  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  39.79 
 
 
187 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  36.08 
 
 
216 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  37.1 
 
 
184 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  38.22 
 
 
185 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  38.22 
 
 
185 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.22 
 
 
198 aa  104  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  36.22 
 
 
198 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  36.22 
 
 
198 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  37.99 
 
 
199 aa  104  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  34.41 
 
 
179 aa  104  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  34.04 
 
 
180 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  34.04 
 
 
180 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  37.08 
 
 
209 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  41.08 
 
 
184 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  39.9 
 
 
192 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.94 
 
 
202 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  35.29 
 
 
184 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  34.05 
 
 
186 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  33.33 
 
 
188 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>