More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0068 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  100 
 
 
185 aa  354  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  75.96 
 
 
185 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  73.77 
 
 
185 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  62.09 
 
 
184 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  63.19 
 
 
184 aa  224  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  63.59 
 
 
184 aa  221  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  68.48 
 
 
184 aa  220  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  59.78 
 
 
185 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  60.11 
 
 
187 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  60.54 
 
 
188 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  60.87 
 
 
183 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  57.46 
 
 
186 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  66.85 
 
 
184 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  66.85 
 
 
184 aa  210  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  56.28 
 
 
188 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  57.98 
 
 
189 aa  207  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  56.76 
 
 
187 aa  205  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  56.76 
 
 
187 aa  205  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  55.68 
 
 
187 aa  201  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  54.64 
 
 
186 aa  201  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  54.44 
 
 
186 aa  195  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  51.91 
 
 
186 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  54.59 
 
 
191 aa  191  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  50.27 
 
 
190 aa  190  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  51.91 
 
 
186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  52.94 
 
 
198 aa  167  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  52.66 
 
 
185 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  46.7 
 
 
185 aa  166  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  50.85 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  53.51 
 
 
184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  51.63 
 
 
185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  54.05 
 
 
184 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  47.46 
 
 
186 aa  155  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  53.51 
 
 
184 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  50.81 
 
 
185 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  45.31 
 
 
192 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  46.52 
 
 
187 aa  135  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  41.3 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  40.98 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  41.08 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  49.68 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  48.31 
 
 
185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  44.62 
 
 
185 aa  124  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  41.08 
 
 
187 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  41.27 
 
 
207 aa  122  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  37.3 
 
 
191 aa  121  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  37.16 
 
 
178 aa  121  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  47.03 
 
 
187 aa  121  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  42.76 
 
 
193 aa  120  8e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  42.76 
 
 
193 aa  120  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  40.84 
 
 
193 aa  120  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  38.92 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  43.41 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  45.34 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  40 
 
 
183 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  41.62 
 
 
193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  44.62 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  33.7 
 
 
199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  36.02 
 
 
190 aa  118  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  36.02 
 
 
184 aa  117  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  43.32 
 
 
185 aa  117  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  43.32 
 
 
185 aa  117  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  45.36 
 
 
188 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  36.02 
 
 
215 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
202 aa  117  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  36.56 
 
 
222 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  34.59 
 
 
193 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  39.33 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  41.57 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  34.59 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.78 
 
 
191 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  34.78 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.78 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  45.1 
 
 
194 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  36.02 
 
 
215 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  36.02 
 
 
215 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  29.73 
 
 
186 aa  115  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  45.56 
 
 
174 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  45.57 
 
 
205 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  36.02 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  45.39 
 
 
198 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  36.56 
 
 
222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  34.76 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  35.37 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  43.79 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  36.56 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  36.56 
 
 
222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  45.39 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  40.54 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  40.33 
 
 
200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  35.87 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  31.38 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  36.41 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  43.89 
 
 
188 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  37.17 
 
 
210 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  39.67 
 
 
192 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  37.1 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  37.16 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  43.58 
 
 
187 aa  111  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  42.7 
 
 
188 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>