More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1191 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  71.35 
 
 		 178 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  66.1 
 
 		 184 aa  249  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  65.73 
 
 		 183 aa  249  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  62.36 
 
 		 178 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  60.8 
 
 		 182 aa  225  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  55.11 
 
 		 177 aa  211  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  35.75 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  36.31 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  36.52 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  34.08 
 
 		 179 aa  124  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4517  hypothetical protein  32.96 
 
 		 202 aa  121  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  34.95 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  32.77 
 
 		 179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  38.04 
 
 		 186 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  32.58 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  36.96 
 
 		 190 aa  114  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  33.15 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  33.51 
 
 		 188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  38.99 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  36.07 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  36.07 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  34.59 
 
 		 186 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  37.43 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  37.43 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  32.07 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  36.26 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  33.33 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  36.07 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  36.11 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  34.1 
 
 		 208 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  34.24 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  36.9 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  36.13 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  32.4 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  36.31 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  33.69 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  32.79 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  33.53 
 
 		 208 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  36.31 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  37.82 
 
 		 186 aa  106  1e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  37.89 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  35.48 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  36.13 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0285  hypothetical protein  35.75 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.119665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  34.08 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  36.46 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  32.6 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  32.6 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  32.79 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  33.15 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  35.08 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  30.77 
 
 		 187 aa  104  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  34.24 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  33.88 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  35.52 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0211  putative methyltransferase  42.06 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.785474  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  34.08 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  34.24 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  33.51 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  32.43 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  36.25 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  35.83 
 
 		 186 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  33.15 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  41.6 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  35.2 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  36.36 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  34.62 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  36.54 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  33.89 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  37.28 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  38.85 
 
 		 227 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  32.78 
 
 		 173 aa  98.6  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1441  methyltransferase  35.2 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  38.22 
 
 		 204 aa  98.6  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  32.78 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  32.74 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1395  putative methyltransferase  35.2 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  37.24 
 
 		 189 aa  98.2  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  41.46 
 
 		 180 aa  98.2  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6231  hypothetical protein  28.81 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  36.07 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  29.51 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  33.16 
 
 		 187 aa  97.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  31.46 
 
 		 202 aa  97.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  30.81 
 
 		 188 aa  97.4  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  34.59 
 
 		 185 aa  97.8  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  28.65 
 
 		 185 aa  97.4  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  31.46 
 
 		 205 aa  97.4  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  35.26 
 
 		 189 aa  97.1  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  33.51 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  33.74 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  32.2 
 
 		 211 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  31.15 
 
 		 184 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  35.57 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  38.4 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0307  methyltransferase  33.16 
 
 		 226 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499795  hitchhiker  0.00000453618 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  28.41 
 
 		 199 aa  95.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  28.18 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 205 aa  95.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>