More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0285 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0285  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  374  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.119665  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1371  hypothetical protein  51.09 
 
 
178 aa  147  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2082  Protein of unknown function methylase putative  49.15 
 
 
172 aa  144  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0462064  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  35.75 
 
 
178 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  37.36 
 
 
184 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  31.11 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  36.17 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  36.17 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  31.18 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  37.36 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  34.81 
 
 
186 aa  94  1e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  34.44 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  34.05 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  26.92 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  40.76 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1881  methyltransferase, putative  35.23 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.752838  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  40.76 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  33.15 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  29.44 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  38.46 
 
 
192 aa  92  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  36.76 
 
 
189 aa  91.7  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  28.89 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  31.64 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  33.9 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  33.15 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  33.15 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  33.15 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  37.08 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  33.15 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  39.25 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  37.36 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  33.15 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  40.62 
 
 
214 aa  89  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  34.46 
 
 
184 aa  89  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  33.7 
 
 
188 aa  89  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  33.7 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  33.15 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  39.01 
 
 
185 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  41.45 
 
 
190 aa  87.8  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  32.61 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  36.17 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  35.48 
 
 
191 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  44.72 
 
 
184 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  37.36 
 
 
185 aa  87  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0284  hypothetical protein  41.95 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129296  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  32.61 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  37.22 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  32.2 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0271  methyltransferase  41.61 
 
 
218 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0389  hypothetical protein  44.08 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  39.13 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  37.78 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  35.68 
 
 
187 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  37.95 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  39.24 
 
 
189 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  38.59 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  33.52 
 
 
198 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  39.24 
 
 
189 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  45.53 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  39.01 
 
 
185 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  30 
 
 
179 aa  85.1  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  31.35 
 
 
186 aa  85.1  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  32.22 
 
 
188 aa  84.7  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  38.42 
 
 
198 aa  84.7  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  30.17 
 
 
183 aa  84.3  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  31.32 
 
 
182 aa  84.3  9e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  38.75 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  38.75 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  38.6 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  29.21 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  32.04 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  32.24 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  32.43 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  30.39 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0244  methyltransferase  41.61 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  26.37 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  39.11 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  47.24 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  36.26 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.02 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  38.04 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1108  hypothetical protein  40.65 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.347631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  38.41 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  41.84 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.76 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  36.96 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35 
 
 
191 aa  82  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  37.1 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  39.36 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  28.57 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  30.53 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0307  methyltransferase  31.28 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499795  hitchhiker  0.00000453618 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  36.57 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.89 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  34.46 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  32.2 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  34.46 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  33.89 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>