More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1467 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  373  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  51.96 
 
 
182 aa  184  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  51.69 
 
 
178 aa  182  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4517  hypothetical protein  47.19 
 
 
202 aa  168  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  41.9 
 
 
179 aa  150  7e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6231  hypothetical protein  39.2 
 
 
183 aa  131  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  32.77 
 
 
178 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  34.46 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  32.2 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  32.2 
 
 
178 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  34.05 
 
 
187 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  33.9 
 
 
182 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  30.51 
 
 
184 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  34.27 
 
 
184 aa  104  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  36.26 
 
 
205 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  32.26 
 
 
186 aa  101  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  35.87 
 
 
192 aa  101  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  30.68 
 
 
182 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  33.16 
 
 
207 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  36.81 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  34.1 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  98.2  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  32.42 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  36.26 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  33.52 
 
 
185 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  32.43 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  30.05 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  32.97 
 
 
187 aa  94.4  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  33.33 
 
 
178 aa  94  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  30.73 
 
 
177 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  34.43 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  30.39 
 
 
199 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  32.22 
 
 
186 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  33.16 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  32.24 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  29.78 
 
 
181 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  33.52 
 
 
188 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  31.32 
 
 
180 aa  92  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  34.76 
 
 
189 aa  91.7  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0182  hypothetical protein  36.02 
 
 
157 aa  91.7  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  35.22 
 
 
184 aa  91.7  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  29.21 
 
 
181 aa  91.3  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  35.16 
 
 
185 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  34.41 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  30.56 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  30.05 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  33.52 
 
 
198 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  30.32 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  31.87 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  30.77 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  30.77 
 
 
187 aa  89.4  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  32.07 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  29.35 
 
 
187 aa  89  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  31.69 
 
 
188 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  31.15 
 
 
191 aa  88.6  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  34.38 
 
 
185 aa  88.6  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  32.62 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  30.6 
 
 
188 aa  87.4  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  31.25 
 
 
187 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  35.77 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  33.92 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  31.02 
 
 
191 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  34.41 
 
 
194 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  35.77 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  33.92 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  28.88 
 
 
188 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0201  putative methyltransferase  31.94 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  32.6 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  30.56 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  31.32 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  30.72 
 
 
199 aa  85.5  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  30.48 
 
 
184 aa  85.1  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  29.05 
 
 
185 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  31.15 
 
 
198 aa  85.1  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  31.15 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  31.15 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  30.6 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  30.6 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  30.6 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  30.6 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  30.6 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  30.6 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  30.77 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0285  hypothetical protein  30 
 
 
191 aa  85.1  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.119665  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  34.23 
 
 
204 aa  84.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  30.17 
 
 
184 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  30.77 
 
 
183 aa  84.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  31.11 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  34.23 
 
 
227 aa  84.3  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  30.6 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1368  hypothetical protein  35.22 
 
 
142 aa  84  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  30.17 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  28.18 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  29.47 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  31.11 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  26.37 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  33.51 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>