More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1300 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  366  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  41.9 
 
 
179 aa  150  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4517  hypothetical protein  43.48 
 
 
202 aa  138  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6231  hypothetical protein  41.34 
 
 
183 aa  137  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  38.89 
 
 
182 aa  134  8e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  39.44 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  34.08 
 
 
178 aa  124  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  38.55 
 
 
182 aa  124  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  35.2 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  33.15 
 
 
178 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  31.28 
 
 
183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  30.73 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  34.41 
 
 
187 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  29.78 
 
 
182 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  32.61 
 
 
193 aa  101  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  32.6 
 
 
179 aa  100  8e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  32.96 
 
 
184 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  33.7 
 
 
180 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  34.21 
 
 
192 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  33.88 
 
 
186 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  36.18 
 
 
182 aa  99.4  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  38.31 
 
 
189 aa  98.6  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  34.46 
 
 
187 aa  98.2  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  34.46 
 
 
187 aa  98.2  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  98.2  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  34.39 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  33.15 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  27.53 
 
 
177 aa  96.3  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  31.68 
 
 
191 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  30.65 
 
 
210 aa  96.3  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  33.55 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  95.5  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  29.51 
 
 
187 aa  95.9  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  34.62 
 
 
173 aa  94.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  32.79 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  94.4  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  33.15 
 
 
191 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  32.97 
 
 
186 aa  93.6  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  34.07 
 
 
203 aa  93.6  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  36.08 
 
 
188 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  28.96 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  29.87 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  31.52 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  39.57 
 
 
193 aa  91.7  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  32.79 
 
 
184 aa  91.3  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  32.48 
 
 
186 aa  91.7  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  33.51 
 
 
189 aa  91.3  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  30.05 
 
 
185 aa  90.9  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  31.15 
 
 
184 aa  90.9  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  30.36 
 
 
208 aa  90.9  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  33.76 
 
 
185 aa  90.9  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  33.77 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  32.68 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  34.22 
 
 
207 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  33.7 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  31.64 
 
 
198 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  34.55 
 
 
188 aa  88.6  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  29.76 
 
 
208 aa  88.2  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4018  hypothetical protein  31.82 
 
 
184 aa  88.2  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  31.89 
 
 
190 aa  88.2  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  31.05 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  31.15 
 
 
185 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  31.72 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  29.19 
 
 
189 aa  87.8  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  31.87 
 
 
202 aa  87.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  33.33 
 
 
228 aa  87.4  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  31.72 
 
 
184 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  31.69 
 
 
187 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  29.12 
 
 
185 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  30.39 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  31.02 
 
 
185 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  34.52 
 
 
177 aa  87  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  31.18 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  30.81 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  38.21 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  29.83 
 
 
192 aa  85.5  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  33.33 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  32.91 
 
 
188 aa  85.1  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  32.56 
 
 
185 aa  85.1  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  30.6 
 
 
184 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  31.79 
 
 
181 aa  85.1  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.94 
 
 
202 aa  85.1  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  30.6 
 
 
186 aa  84.7  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  28.18 
 
 
202 aa  84.3  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  32.61 
 
 
192 aa  84.3  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  31.32 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  29.19 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  29.28 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  32.03 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  32.89 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  31.18 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  31.18 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  30.6 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  31.69 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  30.73 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  30.72 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  32.98 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  29.83 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>