More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1281 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  100 
 
 		 187 aa  358  3e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  85.56 
 
 		 187 aa  314  6e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  60.75 
 
 		 189 aa  204  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  59.68 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  59.04 
 
 		 193 aa  201  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  53.48 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  56.99 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  58.06 
 
 		 189 aa  188  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  54.01 
 
 		 188 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  58.82 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  56.83 
 
 		 188 aa  181  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  58.06 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  53.51 
 
 		 184 aa  171  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  52.75 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  50.26 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  47.59 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  50 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  55.08 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  53.05 
 
 		 175 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  53.05 
 
 		 175 aa  148  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  49.19 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  49.72 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  52.44 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  54.27 
 
 		 174 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  50.54 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  51.96 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  49.46 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  50.92 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  48.97 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  49.73 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  47.59 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  46.28 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  43.09 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  47.12 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  48.89 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  44.32 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  42.93 
 
 		 180 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  47.59 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  47.59 
 
 		 184 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  45.36 
 
 		 191 aa  117  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  42.78 
 
 		 185 aa  117  9e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  44.92 
 
 		 184 aa  117  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  47.31 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  37.23 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  38.38 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  46.2 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  42.93 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  44.58 
 
 		 196 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  33.15 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  43.09 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  43.65 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  38.25 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  35.14 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.96 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  39.23 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  44.69 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  39.04 
 
 		 191 aa  110  9e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  37.2 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  41.08 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  40.46 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.36 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  41.05 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.79 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  39.24 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  40 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.36 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  41.14 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  42.24 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  38.1 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  32.97 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  43.01 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  36.17 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.36 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  34.44 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  38.67 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  38.67 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  36.14 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  43.78 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  41.62 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  42.41 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  41.07 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  39.11 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  28.49 
 
 		 178 aa  105  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  36.31 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  39.69 
 
 		 190 aa  104  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  36.31 
 
 		 181 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  40 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  38.12 
 
 		 182 aa  104  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  39.89 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  39.89 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.36 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  39.01 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  32.97 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  37.82 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  35.29 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.36 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>