More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1604 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  100 
 
 
187 aa  361  4e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  53.76 
 
 
189 aa  178  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  53.51 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  60.42 
 
 
192 aa  166  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  55.8 
 
 
184 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  58.79 
 
 
186 aa  166  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  52.85 
 
 
193 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  54.89 
 
 
198 aa  164  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  53.48 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  53.89 
 
 
191 aa  163  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  54.4 
 
 
203 aa  162  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  52.49 
 
 
186 aa  159  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  53.04 
 
 
189 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  54.4 
 
 
204 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  52.13 
 
 
202 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  51.89 
 
 
193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  48.65 
 
 
184 aa  152  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  48.9 
 
 
188 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  50 
 
 
188 aa  150  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  49.72 
 
 
189 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  50.78 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  49.72 
 
 
187 aa  145  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  48.6 
 
 
187 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  54.24 
 
 
185 aa  141  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  55.14 
 
 
187 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  50 
 
 
174 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  53.76 
 
 
185 aa  137  7e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  49.08 
 
 
174 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  47.25 
 
 
190 aa  134  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  48.9 
 
 
187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  48.47 
 
 
202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  45.6 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  44.44 
 
 
185 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  45.61 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  45.61 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  45.61 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  43.72 
 
 
186 aa  125  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  49.08 
 
 
196 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  44.5 
 
 
185 aa  122  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  47.03 
 
 
185 aa  121  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  41.76 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  40.54 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  43.96 
 
 
188 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  43.09 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  40.96 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  43.92 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  43.02 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  47.28 
 
 
205 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  38.41 
 
 
202 aa  114  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  43.85 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  44.02 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  40.22 
 
 
187 aa  112  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  36.84 
 
 
207 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  56 
 
 
179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  46.71 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  45.45 
 
 
188 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  42.62 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  54.84 
 
 
179 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  46.24 
 
 
185 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  54.84 
 
 
179 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  43.33 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  47.1 
 
 
183 aa  108  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  40.66 
 
 
186 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  40 
 
 
190 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  42.39 
 
 
183 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  42.78 
 
 
190 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  42.7 
 
 
192 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  45.11 
 
 
184 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  40.22 
 
 
187 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  45.11 
 
 
184 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  45.11 
 
 
184 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.58 
 
 
202 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  43.48 
 
 
201 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  38.86 
 
 
187 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  38.86 
 
 
187 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  43.59 
 
 
186 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  35.79 
 
 
184 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  37.7 
 
 
198 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  37.63 
 
 
198 aa  104  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  42.27 
 
 
185 aa  104  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  37.63 
 
 
198 aa  104  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2064  putative methyltransferase  45.05 
 
 
179 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371862  normal  0.712405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  36.9 
 
 
194 aa  104  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  36.36 
 
 
182 aa  103  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  43.92 
 
 
197 aa  103  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  37.36 
 
 
201 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  38.25 
 
 
188 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  38.8 
 
 
189 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  37.37 
 
 
193 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  41.57 
 
 
187 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  37.1 
 
 
198 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.1 
 
 
198 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.1 
 
 
198 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.1 
 
 
198 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.1 
 
 
198 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  37.82 
 
 
187 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  38.1 
 
 
186 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  41.72 
 
 
188 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  37.91 
 
 
186 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.56 
 
 
198 aa  101  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>