More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2470 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  61.75 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  58.47 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  61.29 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  57.92 
 
 		 184 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  57.38 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  56.83 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  54.35 
 
 		 185 aa  174  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  50.27 
 
 		 184 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  50.26 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  51.63 
 
 		 185 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  49.73 
 
 		 184 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  50 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  49.73 
 
 		 185 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  48.65 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  52.17 
 
 		 185 aa  157  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  48.65 
 
 		 187 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  49.2 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  50.27 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  48.68 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  48.37 
 
 		 191 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  47.57 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  48.11 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  47.57 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  47.28 
 
 		 186 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  44.68 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  45.26 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  50.82 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  48.65 
 
 		 188 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  44.68 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  45.74 
 
 		 186 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  50.27 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  50.27 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  45.05 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  46.28 
 
 		 186 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  43.39 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  44.15 
 
 		 185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  44.15 
 
 		 185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  44.02 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  50.31 
 
 		 197 aa  127  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  42.78 
 
 		 207 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  42.33 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  41.58 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  40.11 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  48.73 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  40.22 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  44.5 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  43.72 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  41.05 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  42.78 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  38.02 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  43.09 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  43.09 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  36.76 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  42.78 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  40 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  38.46 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  35.71 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  38.74 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  36.9 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.01 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.01 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  44.91 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  44.44 
 
 		 202 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  38.62 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  42.02 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  38.54 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  42.77 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  42.41 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  42.55 
 
 		 200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  42.7 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  41.08 
 
 		 180 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  37.3 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  41.18 
 
 		 198 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  35.36 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  42.55 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  41.88 
 
 		 190 aa  111  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  35.68 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  39.01 
 
 		 182 aa  111  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  36.84 
 
 		 186 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  41.76 
 
 		 203 aa  110  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.98 
 
 		 202 aa  110  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  41.62 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  38.3 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  43.75 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  40.54 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  41.88 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  41.08 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  43.41 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  36.02 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  38.54 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  39.78 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  40 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  41.25 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  41.25 
 
 		 215 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  38.07 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  40 
 
 		 189 aa  107  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.3 
 
 		 220 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.3 
 
 		 220 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  38.34 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>