More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0901 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  100 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  97.83 
 
 		 184 aa  358  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  82.61 
 
 		 184 aa  307  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  67.03 
 
 		 198 aa  233  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  61.29 
 
 		 185 aa  210  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  59.56 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  57.38 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  50.26 
 
 		 184 aa  165  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  49.2 
 
 		 185 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  53.51 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  48.39 
 
 		 187 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  48.4 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  48.92 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  48.92 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  48.39 
 
 		 183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  49.74 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  47.34 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  48.42 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  51.63 
 
 		 184 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  51.31 
 
 		 192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  47.85 
 
 		 188 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  47.85 
 
 		 186 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  50.54 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  45.99 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  49.46 
 
 		 185 aa  141  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  50.54 
 
 		 184 aa  140  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  48.98 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  50 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  45.99 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  43.85 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  43.85 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  45.5 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  50 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  45.3 
 
 		 186 aa  131  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  45.45 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  34.21 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  42.31 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  42.07 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  39.47 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  41.27 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  41.27 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  45.6 
 
 		 192 aa  110  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.88 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  45.29 
 
 		 191 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  42.05 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  39.76 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  39.76 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  38.86 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  37.37 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  41.71 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  37.43 
 
 		 178 aa  104  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  43.09 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  35.6 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  32.98 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  36.65 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  39.78 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  38.22 
 
 		 193 aa  102  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  35.57 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  37.77 
 
 		 189 aa  100  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  37.04 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  31.02 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  43.62 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.05 
 
 		 207 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  41.8 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  41.05 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  38.54 
 
 		 194 aa  98.6  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  42.86 
 
 		 208 aa  98.2  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  41.84 
 
 		 196 aa  98.2  5e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.6 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  35.11 
 
 		 210 aa  97.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.45 
 
 		 207 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.11 
 
 		 198 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  38.74 
 
 		 193 aa  97.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.45 
 
 		 207 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.45 
 
 		 207 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  39.2 
 
 		 197 aa  97.4  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  34.39 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  34.39 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  41.77 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  42.11 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  44.93 
 
 		 184 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.11 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.11 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.11 
 
 		 198 aa  95.5  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.11 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  40.12 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.58 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  38.92 
 
 		 187 aa  95.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  45.16 
 
 		 208 aa  94.7  6e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  39.74 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.48 
 
 		 220 aa  94.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.48 
 
 		 220 aa  94.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  42.77 
 
 		 174 aa  94.4  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.52 
 
 		 198 aa  94.4  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.48 
 
 		 220 aa  94.4  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  44.24 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.35 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  40.4 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  38.92 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>