More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0478 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  100 
 
 		 186 aa  376  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  97.31 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  76.22 
 
 		 186 aa  294  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  69.57 
 
 		 186 aa  262  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  58.15 
 
 		 187 aa  222  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  58.7 
 
 		 187 aa  222  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  58.15 
 
 		 187 aa  222  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  54.44 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  52.43 
 
 		 185 aa  198  5e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  53.26 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  53.85 
 
 		 184 aa  194  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  51.91 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  51.37 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  51.93 
 
 		 183 aa  187  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  53.85 
 
 		 184 aa  187  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  52.75 
 
 		 184 aa  184  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  50.55 
 
 		 185 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  50.27 
 
 		 188 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  52.43 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  50.82 
 
 		 188 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  46.74 
 
 		 190 aa  174  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  52.11 
 
 		 189 aa  174  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  47.85 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  47.03 
 
 		 187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  50.82 
 
 		 184 aa  160  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  50.82 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  45.11 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  50.82 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  44.68 
 
 		 185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  44.21 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  46.28 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  46.11 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  46.07 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  45.99 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  45.99 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  37.84 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  44.81 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  42.25 
 
 		 192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  46.88 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  41.18 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  41.18 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  34.59 
 
 		 186 aa  121  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  38.62 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  36.07 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  38.3 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  38.38 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  38.59 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  43.23 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  36.51 
 
 		 207 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  37.1 
 
 		 207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  34.81 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  35.68 
 
 		 184 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  41.71 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  33.69 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  34.22 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  42.86 
 
 		 203 aa  111  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  32.45 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  40.44 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  31.87 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  32.09 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  39.34 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  40.99 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  36.81 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0201  putative methyltransferase  31.79 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  41.18 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  39.1 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  31.15 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  35.14 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  35.52 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  32.62 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  37.77 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  39.46 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  46.45 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  34.38 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  32.26 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  34.57 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  44.08 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  39.01 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  34.24 
 
 		 178 aa  104  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  31.55 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  31.55 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  34.05 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  35.68 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  38.5 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  31.55 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1433  putative methyltransferase  33.85 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  32.09 
 
 		 222 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  33.51 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  32.09 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  32.09 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  39.51 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  41.73 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  33.52 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  40.45 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  34.22 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  32.46 
 
 		 207 aa  101  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  32.07 
 
 		 209 aa  101  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  34.24 
 
 		 187 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  30.94 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  32.43 
 
 		 216 aa  101  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>