More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3860 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  100 
 
 		 184 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  99.46 
 
 		 184 aa  352  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  90.76 
 
 		 184 aa  303  8.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  66.85 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  67.03 
 
 		 185 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  66.67 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  57.61 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  57.38 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  55.74 
 
 		 188 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  57.14 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  56.59 
 
 		 184 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  54.05 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  51.63 
 
 		 190 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  57.07 
 
 		 184 aa  182  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  55.74 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  57.22 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  53.51 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  54.45 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  50.56 
 
 		 186 aa  173  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  51.12 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  51.12 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  50.54 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  51.12 
 
 		 187 aa  167  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  51.11 
 
 		 186 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  50.82 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  51.85 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  50 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  52.17 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  52.17 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  50.27 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  47.57 
 
 		 187 aa  148  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  45.99 
 
 		 185 aa  147  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  46.52 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  46.81 
 
 		 192 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  41.08 
 
 		 188 aa  140  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  42.7 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  48.63 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  46.28 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  39.89 
 
 		 207 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  44.81 
 
 		 185 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  43.24 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  44.26 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  47.59 
 
 		 187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  42.29 
 
 		 192 aa  124  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  41.8 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  48.19 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  47.88 
 
 		 205 aa  121  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  41.57 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  44.62 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  40.59 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.42 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.42 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  40.59 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  31.89 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  38.3 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.61 
 
 		 198 aa  117  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  38.59 
 
 		 183 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  40.76 
 
 		 209 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  36.31 
 
 		 178 aa  117  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  40.61 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.61 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.61 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.61 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  43.26 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  45.79 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  45.79 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.61 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  38.64 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  43.5 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.59 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  34.97 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  34.05 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  40 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.59 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.59 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  40 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.59 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.59 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  44.26 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  40.88 
 
 		 180 aa  115  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.05 
 
 		 199 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  45.36 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.21 
 
 		 199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  43.01 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  38.07 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  38.38 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  40.66 
 
 		 180 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  34.97 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  40.2 
 
 		 202 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  40.24 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  42.35 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  36.17 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.12 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  38.95 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  37.5 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  38.71 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>