More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0115 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  100 
 
 		 185 aa  363  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  59.56 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  61.29 
 
 		 185 aa  200  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  59.02 
 
 		 184 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  58.38 
 
 		 198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  59.56 
 
 		 184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  57.92 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  51.58 
 
 		 184 aa  157  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  49.21 
 
 		 185 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  49.46 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  46.32 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  46.32 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  50.26 
 
 		 183 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  48.44 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  45.26 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  50.81 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  52.9 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  48.42 
 
 		 187 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  45.65 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  44.44 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  47.37 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  47.62 
 
 		 186 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  49.73 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  50.27 
 
 		 184 aa  136  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  47.06 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  46.32 
 
 		 186 aa  134  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  49.46 
 
 		 185 aa  134  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  45.36 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  46.96 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  48.98 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  47.54 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  47.54 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  45.74 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  42.25 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  44.81 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  44.09 
 
 		 183 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  42.78 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  42.19 
 
 		 194 aa  121  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  43.81 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  43.81 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  44.79 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  45.45 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  45.79 
 
 		 196 aa  114  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  44.51 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  46.77 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  40.51 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  38.95 
 
 		 188 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  48.1 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  41.88 
 
 		 192 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  45.36 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  42.78 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  47.12 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  41.88 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  44.44 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  41.92 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  44.02 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  43.01 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  42.47 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  40.1 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  35.42 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  44.26 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  39.38 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  41.62 
 
 		 193 aa  104  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  44.75 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  39.58 
 
 		 186 aa  104  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  44.81 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  42.93 
 
 		 202 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  42.16 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  42.17 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  46.41 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  37.97 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  33.69 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  49.22 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  38.86 
 
 		 187 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  35.11 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  42.22 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.77 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.4 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.31 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  37.17 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.77 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  29.02 
 
 		 183 aa  99.4  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  37.43 
 
 		 178 aa  98.6  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.03 
 
 		 191 aa  98.2  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  39.89 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  33.51 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  40.41 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  44.1 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  45.59 
 
 		 205 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  35.6 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 180 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  40.62 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  45.45 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.4 
 
 		 191 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  40.38 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  39.67 
 
 		 192 aa  96.3  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  37.06 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  37.77 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>