More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4034 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  100 
 
 
184 aa  347  6e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  57.07 
 
 
188 aa  191  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  53.85 
 
 
185 aa  181  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  55.14 
 
 
187 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  56.76 
 
 
193 aa  175  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  55.49 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  53.51 
 
 
187 aa  171  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  53.51 
 
 
186 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  56.57 
 
 
189 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  52.43 
 
 
189 aa  167  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  53.8 
 
 
202 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  54.59 
 
 
189 aa  164  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  54.49 
 
 
188 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  52.15 
 
 
193 aa  158  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  51.09 
 
 
188 aa  154  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  48.65 
 
 
187 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  56.68 
 
 
185 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  54.29 
 
 
186 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  48.37 
 
 
198 aa  149  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  49.74 
 
 
189 aa  148  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  48.35 
 
 
203 aa  144  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  46.45 
 
 
190 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  48.09 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  50.94 
 
 
174 aa  137  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  47.17 
 
 
174 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  50.26 
 
 
192 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  46.95 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  46.95 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  46.95 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  44.44 
 
 
191 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  45.56 
 
 
184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  42.16 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  45.16 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  45.99 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  49.37 
 
 
196 aa  114  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  45.79 
 
 
204 aa  114  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.87 
 
 
202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  34.78 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  41.4 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  43.17 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  44.21 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  43.55 
 
 
197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  39.66 
 
 
200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  39.66 
 
 
200 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  41.85 
 
 
186 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  38.51 
 
 
200 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  38.12 
 
 
183 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  43.24 
 
 
185 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  43.65 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  41.62 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  39.08 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  40.64 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  44.81 
 
 
189 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  43.96 
 
 
180 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  35.39 
 
 
199 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  37.29 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  43.75 
 
 
201 aa  107  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  40.98 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  40.44 
 
 
187 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  40.44 
 
 
187 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  39.78 
 
 
186 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  41.4 
 
 
187 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  41.81 
 
 
185 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  36.11 
 
 
181 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  44.62 
 
 
187 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  42.41 
 
 
185 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  32.94 
 
 
203 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  39.25 
 
 
207 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  46.99 
 
 
187 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  42.31 
 
 
183 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  39.13 
 
 
188 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  41.3 
 
 
185 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  33.52 
 
 
184 aa  105  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  39.89 
 
 
188 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  37.97 
 
 
182 aa  105  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  38.64 
 
 
178 aa  104  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  52.8 
 
 
179 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  33.89 
 
 
209 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  43.68 
 
 
192 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  52.8 
 
 
179 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  52.8 
 
 
179 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  39.78 
 
 
187 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  39.67 
 
 
190 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  43.17 
 
 
182 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  41.01 
 
 
188 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  40.23 
 
 
200 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  46.41 
 
 
185 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  43.1 
 
 
192 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  46.53 
 
 
184 aa  101  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  42.05 
 
 
192 aa  101  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  42.76 
 
 
184 aa  101  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  50.82 
 
 
177 aa  101  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  34.41 
 
 
184 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  42.16 
 
 
184 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  44.03 
 
 
180 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  35.87 
 
 
191 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  36.46 
 
 
185 aa  100  2e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  35.56 
 
 
180 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  28.57 
 
 
185 aa  99.4  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  42.16 
 
 
184 aa  99  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>