More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1372 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  339  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  46.11 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  38.59 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  38.04 
 
 
187 aa  124  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  37.43 
 
 
188 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  42.22 
 
 
198 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  43.68 
 
 
191 aa  122  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  36.31 
 
 
188 aa  121  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  36.31 
 
 
188 aa  121  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  36.31 
 
 
188 aa  121  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  38.2 
 
 
189 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  36.31 
 
 
188 aa  121  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  36.31 
 
 
188 aa  121  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  36.31 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  36.31 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  35.75 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  36.31 
 
 
188 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  43.03 
 
 
182 aa  118  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  36.31 
 
 
188 aa  119  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  42.7 
 
 
187 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  52.46 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  40.86 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  41.11 
 
 
189 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  36.31 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  40.74 
 
 
188 aa  114  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  50.82 
 
 
184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  41.9 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  48.07 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  48.07 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  47.51 
 
 
179 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  44.25 
 
 
205 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  39.56 
 
 
185 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  39.56 
 
 
185 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  43.98 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2064  putative methyltransferase  46.67 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371862  normal  0.712405 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  38.2 
 
 
184 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  43.33 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  35.2 
 
 
187 aa  108  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  47.2 
 
 
207 aa  107  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  38.5 
 
 
180 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  43.33 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  40.98 
 
 
191 aa  107  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  40.33 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  36.11 
 
 
186 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  38.04 
 
 
212 aa  106  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  41.53 
 
 
187 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  50.81 
 
 
193 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  43.01 
 
 
185 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  42.17 
 
 
192 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  39.64 
 
 
208 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  32.62 
 
 
186 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  39.64 
 
 
208 aa  104  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  40 
 
 
185 aa  104  6e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  44.72 
 
 
185 aa  104  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  50 
 
 
193 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  38.95 
 
 
187 aa  103  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  38.95 
 
 
187 aa  103  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  40.54 
 
 
186 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  40 
 
 
184 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  41.53 
 
 
187 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  36.65 
 
 
179 aa  102  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  40.66 
 
 
186 aa  101  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  38.62 
 
 
187 aa  101  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  50.82 
 
 
184 aa  101  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  42.14 
 
 
182 aa  101  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  44.44 
 
 
184 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  40.74 
 
 
187 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  41.27 
 
 
186 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  40 
 
 
198 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  36.02 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  43.41 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  41.8 
 
 
184 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  43.02 
 
 
175 aa  99  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  41.99 
 
 
184 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  37.57 
 
 
186 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.37 
 
 
194 aa  98.6  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  34.78 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  39.15 
 
 
186 aa  98.2  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  43.02 
 
 
175 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  32.42 
 
 
185 aa  98.2  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  43.02 
 
 
175 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  40.74 
 
 
184 aa  97.8  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  31.87 
 
 
185 aa  97.8  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  46.53 
 
 
196 aa  97.4  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  31.79 
 
 
183 aa  97.4  9e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  47.54 
 
 
185 aa  97.4  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  45.65 
 
 
189 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  40.54 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  40.44 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  37.23 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  39.87 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  41.34 
 
 
190 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  49.28 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.9 
 
 
220 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.9 
 
 
220 aa  96.3  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  44.26 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  43.65 
 
 
186 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  39.02 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  37.63 
 
 
185 aa  95.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.35 
 
 
191 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>