More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1600 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  100 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  69.15 
 
 		 190 aa  257  8e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  57.61 
 
 		 189 aa  214  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  55.61 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  51.63 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  55.43 
 
 		 186 aa  180  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  34.95 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  37.57 
 
 		 180 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  39.89 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  35.87 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  40 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  35.26 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  38.59 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  35.33 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  33.85 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  35.64 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  36.96 
 
 		 178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  32.61 
 
 		 179 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  41.67 
 
 		 184 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  31.91 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  34.39 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  35.26 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  35.26 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  36.32 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  40.22 
 
 		 203 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  36.02 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  39.89 
 
 		 191 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  39.49 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  42.86 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  40.76 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  39.34 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  39.13 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  38.18 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  40.51 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  40.26 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  40.41 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  38.22 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  38.22 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  39.61 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  35.83 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 187 aa  108  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  36.9 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  41.56 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  36.22 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  37.01 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  42.78 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  38.96 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  34.57 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  38.96 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  36.7 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  36.56 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  41.4 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  38.95 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  37.66 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  36.56 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  36.56 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  36.56 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  36.56 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  34.92 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  37.23 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  34.04 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  36.96 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  34.74 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  41.58 
 
 		 192 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  40.54 
 
 		 185 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0211  putative methyltransferase  32.61 
 
 		 183 aa  104  7e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.785474  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  35.68 
 
 		 186 aa  104  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  36.98 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  43.01 
 
 		 192 aa  104  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.94 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  41.45 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  36.41 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  38.76 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  36.11 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  41.4 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  36.41 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  36.41 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  42.6 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  38.1 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  34.95 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  37.37 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  47.55 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  38.42 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  42.21 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  42.08 
 
 		 204 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  42.94 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  38.14 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.03 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  37.58 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  39.24 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  35.64 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>