More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0429 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  60.11 
 
 
187 aa  226  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  60.11 
 
 
187 aa  226  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  60.11 
 
 
187 aa  225  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  60 
 
 
183 aa  214  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  56.91 
 
 
184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  66.45 
 
 
186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  57.46 
 
 
185 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  58.89 
 
 
185 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  56.11 
 
 
186 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  55 
 
 
186 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  54.14 
 
 
187 aa  200  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  52.46 
 
 
185 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  53.04 
 
 
184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  55 
 
 
184 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  56.67 
 
 
185 aa  194  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  54.44 
 
 
186 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  51.34 
 
 
189 aa  190  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  50.28 
 
 
188 aa  187  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  51.12 
 
 
185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  51.34 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  53.98 
 
 
188 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  49.17 
 
 
190 aa  180  9.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  50 
 
 
191 aa  179  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  48.09 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  52.22 
 
 
184 aa  170  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  50.82 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  50.56 
 
 
184 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  50.56 
 
 
184 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  48.39 
 
 
198 aa  158  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  47.28 
 
 
185 aa  153  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  43.48 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  44.86 
 
 
184 aa  137  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  46.96 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  45.57 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  45.86 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  45.3 
 
 
184 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  41.3 
 
 
193 aa  130  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  38.25 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.5 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  41.4 
 
 
188 aa  125  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  41.3 
 
 
189 aa  124  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  41.4 
 
 
187 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  39.36 
 
 
207 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  38.17 
 
 
189 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  42.02 
 
 
185 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  42.02 
 
 
185 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  41.53 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  41.85 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  43.51 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  42.78 
 
 
185 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  42.76 
 
 
180 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.56 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  39.25 
 
 
207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  40.76 
 
 
189 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  32.11 
 
 
185 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  39.27 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  41.85 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  42.62 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  40.88 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  40.8 
 
 
192 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  32.61 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.38 
 
 
206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  37.36 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  37.21 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.15 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  42.77 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.8 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  40.12 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  40.54 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  37.29 
 
 
178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  41.85 
 
 
184 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  39.75 
 
 
189 aa  112  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  38.25 
 
 
187 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  32.04 
 
 
184 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  38.96 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  37.5 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  39.88 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  36.7 
 
 
190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  38.31 
 
 
186 aa  111  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  44.38 
 
 
173 aa  111  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.98 
 
 
207 aa  111  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.29 
 
 
198 aa  111  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.53 
 
 
198 aa  111  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  42.29 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  39.88 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.29 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.29 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  36.56 
 
 
193 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  40.8 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.95 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.95 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  39.34 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  40.8 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  37.42 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  36.56 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1433  putative methyltransferase  34.33 
 
 
195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.95 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  41.72 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  39.88 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>