More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0907 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  76.22 
 
 		 186 aa  296  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  76.22 
 
 		 186 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  74.46 
 
 		 186 aa  274  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  63.04 
 
 		 187 aa  229  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  63.04 
 
 		 187 aa  229  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  63.04 
 
 		 187 aa  228  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  56.11 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  54.05 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  55.25 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  54.44 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  54.7 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  54.44 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  53.01 
 
 		 187 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  53.59 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  55.25 
 
 		 184 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  58.38 
 
 		 189 aa  191  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  50.82 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  52.49 
 
 		 184 aa  187  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  53.51 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  51.37 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  47.31 
 
 		 190 aa  174  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  50.81 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  52.22 
 
 		 184 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  47.31 
 
 		 191 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  50.27 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  51.11 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  51.11 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  44.86 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  48.15 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  47.87 
 
 		 185 aa  148  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  43.92 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  47.85 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  47.85 
 
 		 184 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  46.24 
 
 		 184 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  46.32 
 
 		 185 aa  134  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  38.71 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  130  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  42.93 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  42.16 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  45.83 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  45.83 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  38.12 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  37.57 
 
 		 207 aa  120  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  40.11 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  39.57 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  38.1 
 
 		 207 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  33.33 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  41.14 
 
 		 228 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  40 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  35.91 
 
 		 180 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  40.32 
 
 		 202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  34.24 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  37.1 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  39.46 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  36.41 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  39.13 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  38.8 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  32.26 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  40.11 
 
 		 188 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  35.98 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  41.67 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0201  putative methyltransferase  31.28 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  34.78 
 
 		 209 aa  108  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  37.02 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  35.6 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  40.24 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  37.84 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  33.16 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  36.61 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  30.48 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  34.78 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  34.04 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  35.71 
 
 		 200 aa  104  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  34.76 
 
 		 190 aa  104  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  36.02 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  41.83 
 
 		 193 aa  104  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  42.86 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  42.16 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  44.06 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.76 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  43.65 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  34.78 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  32.09 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  41.45 
 
 		 187 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  43.9 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.22 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  37.11 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  32.42 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  47.66 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  36.9 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.07 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  34.24 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.06 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  45.04 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  35.83 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  34.43 
 
 		 206 aa  101  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  32.62 
 
 		 199 aa  101  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  39.25 
 
 		 187 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  38.89 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>