More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1357 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  100 
 
 		 188 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  86.81 
 
 		 185 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  86.02 
 
 		 187 aa  317  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  78.26 
 
 		 184 aa  293  9e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  80.98 
 
 		 188 aa  289  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  76.92 
 
 		 184 aa  286  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  77.47 
 
 		 184 aa  275  4e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  62.3 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  62.3 
 
 		 183 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  60.11 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  56.28 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  54.64 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  56.91 
 
 		 191 aa  191  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  55.03 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  50.82 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  49.19 
 
 		 190 aa  188  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  50.28 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  50.27 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  51.14 
 
 		 187 aa  180  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  55.74 
 
 		 184 aa  178  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  55.74 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  53.55 
 
 		 184 aa  177  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  49.43 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  49.43 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  50.27 
 
 		 186 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  51.35 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  50.53 
 
 		 198 aa  167  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  48.4 
 
 		 185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  48.65 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  46.59 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  49.46 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  48.92 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  43.32 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  46.77 
 
 		 184 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  44.74 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  47.06 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  41.8 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  44.77 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  43.32 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  39.68 
 
 		 207 aa  123  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  41.44 
 
 		 189 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  44.38 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  37.3 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  39.13 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  42.39 
 
 		 192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3469  hypothetical protein  40.32 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0545703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  42.04 
 
 		 186 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  43.96 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  39.74 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  41.38 
 
 		 192 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  40.76 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  41.88 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  35.45 
 
 		 194 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.38 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.14 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  40.84 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  40.76 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  40.31 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  41.67 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  41.67 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  35.91 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  40.98 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  40.44 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  44.07 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  43.85 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  41.18 
 
 		 187 aa  108  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  34.62 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.32 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  38.62 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  35.83 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  38.92 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  38.92 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  39.34 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  36.76 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.32 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.32 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  35.71 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  37.5 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  42.41 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  38.32 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.32 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  39.89 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.32 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  38.54 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  35.87 
 
 		 190 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  31.58 
 
 		 184 aa  104  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  37.91 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  32.97 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.86 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  40 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  31.89 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  46.84 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.72 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  32.02 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  37.1 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  40.21 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  34.68 
 
 		 193 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  35.33 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  37.23 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>