More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3284 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  100 
 
 		 198 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  60.54 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  56.77 
 
 		 193 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  54.89 
 
 		 189 aa  184  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  58.06 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  53.26 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  54.59 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  55.91 
 
 		 187 aa  175  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  52.2 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  51.09 
 
 		 189 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  55.43 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  52.97 
 
 		 188 aa  164  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  54.89 
 
 		 187 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  51.89 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  49.25 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  49.74 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  53.8 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  54.74 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  50.5 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  50.54 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  56.52 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  48.65 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  48.37 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  47.15 
 
 		 189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  47.34 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  49.73 
 
 		 188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  51.15 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  51.15 
 
 		 175 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  51.15 
 
 		 175 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  48.4 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  47.93 
 
 		 174 aa  137  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  41.53 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  48.48 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  38.07 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  51.56 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  50.81 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  42.86 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  43.55 
 
 		 187 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  45.16 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  43.32 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  41.53 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  47.67 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  43.68 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  37.16 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  40.78 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  41.88 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  43.01 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  45.92 
 
 		 191 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  44.51 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  35.75 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  38.59 
 
 		 193 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  41.71 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.22 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.68 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.68 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.22 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.68 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  39.67 
 
 		 193 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  39.89 
 
 		 190 aa  111  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  39.15 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.11 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2064  putative methyltransferase  45.45 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371862  normal  0.712405 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.11 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  36.61 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  37.89 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  40.41 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  34.27 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.34 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1931  hypothetical protein  38.04 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891144  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  43.72 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  39.55 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.55 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.55 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.55 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.55 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  33.52 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  40.78 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  42.71 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  33.51 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  38.98 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  35.45 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  38.92 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  38.98 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.98 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  40.88 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  34.44 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  37.37 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  34.74 
 
 		 183 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  40.32 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  40.21 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  43.24 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  36.52 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  43.24 
 
 		 179 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  39.67 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  41.25 
 
 		 187 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  36.11 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  36.11 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  30.81 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>