More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0321 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  100 
 
 		 194 aa  395  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1086  N6-adenine-specific methylase  56.13 
 
 		 164 aa  177  7e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  43.39 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  38.95 
 
 		 191 aa  135  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  43.01 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  40.31 
 
 		 184 aa  131  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  41.36 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  40.7 
 
 		 184 aa  121  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  40.54 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  37.04 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  35.75 
 
 		 198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  38.78 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  39.38 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  38.46 
 
 		 187 aa  112  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  34.95 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  37.24 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  39.68 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  38.19 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  38.42 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  38.42 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  36.92 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  36.92 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  41.21 
 
 		 175 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  37.11 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  37.36 
 
 		 174 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  35.57 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  36.41 
 
 		 188 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  34.72 
 
 		 190 aa  104  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  37.82 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  40.61 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  37.71 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  40.61 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  38.34 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  37.11 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  37.11 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  38.54 
 
 		 202 aa  101  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  35.45 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  36 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  34.2 
 
 		 187 aa  101  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  37.7 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  36.04 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  35.05 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  35.38 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  34.36 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  38.32 
 
 		 187 aa  98.6  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  34.63 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  35.63 
 
 		 174 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  35.68 
 
 		 188 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  38.24 
 
 		 189 aa  97.8  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  34.54 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  34.54 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  32.64 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  32.75 
 
 		 185 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  35.08 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  34.95 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  35.75 
 
 		 184 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  40.51 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  35.26 
 
 		 189 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  36.13 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  34.69 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  35.03 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  34.2 
 
 		 185 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  34.92 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  31.41 
 
 		 178 aa  93.2  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  34.39 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  33.5 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  36.27 
 
 		 185 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  38.76 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  38.81 
 
 		 185 aa  91.3  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  32.99 
 
 		 186 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  32.62 
 
 		 182 aa  91.7  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  34.72 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  34.34 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  34.92 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  35.35 
 
 		 184 aa  91.3  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  35.6 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  33.84 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  37.31 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  34.85 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  32.09 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  34.55 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  32.8 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  36.87 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  38.64 
 
 		 188 aa  89.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  32.8 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  34.87 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  32.8 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  32.09 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  35.14 
 
 		 186 aa  89.7  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  33.5 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  34.21 
 
 		 212 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  35.98 
 
 		 185 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  33.51 
 
 		 187 aa  88.6  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  35 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  34.9 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4018  hypothetical protein  31.32 
 
 		 184 aa  87.8  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  33.67 
 
 		 205 aa  87.8  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  34.18 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  47.22 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>