More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2067 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  100 
 
 		 187 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  55.25 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  51.35 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  48.09 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  48.37 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  48.94 
 
 		 189 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  50.92 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  48.9 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  48.6 
 
 		 193 aa  141  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  50.84 
 
 		 188 aa  141  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  48.81 
 
 		 175 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  48.81 
 
 		 175 aa  141  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  48.81 
 
 		 175 aa  141  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  48.09 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  46.45 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  49.44 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  48.89 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  48.39 
 
 		 202 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  45.41 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  46.28 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  45.16 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  46.33 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  44.92 
 
 		 185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  47.8 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  46.52 
 
 		 186 aa  131  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  45.21 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  49.19 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  44.97 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  44.44 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  45.2 
 
 		 185 aa  127  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  39.44 
 
 		 184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  46.49 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  46.19 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  47.56 
 
 		 174 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  39.77 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  42.7 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  43.68 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  41.9 
 
 		 184 aa  121  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  41.85 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  42.93 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  40.44 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  40.44 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  44.81 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  44.81 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  40.41 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  43.32 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  40.32 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  43.72 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  43.01 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  41.3 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  43.32 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.51 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.51 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.51 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  44.09 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  37.97 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  36.46 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  38.76 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  38.17 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  38.17 
 
 		 222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  36.46 
 
 		 183 aa  115  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  48.48 
 
 		 183 aa  115  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  42.93 
 
 		 189 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  40.11 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  46.05 
 
 		 228 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  40.22 
 
 		 184 aa  114  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  36.46 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  41.67 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  41.48 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  41.48 
 
 		 200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  44.38 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  36.26 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  37.16 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  45 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  45.56 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  44.44 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  41.44 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  37.57 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  43.16 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.41 
 
 		 202 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  39.13 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  38.92 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  39.77 
 
 		 200 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.78 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.34 
 
 		 199 aa  111  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  40.68 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  44.87 
 
 		 192 aa  111  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  38.55 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.77 
 
 		 206 aa  110  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  41.48 
 
 		 200 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  42.33 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  41.1 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  40.76 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  41.71 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  38.76 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  38.71 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.11 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.76 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  44.87 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>