More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1438 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  380  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  66.1 
 
 
178 aa  249  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  64.97 
 
 
178 aa  247  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  61.02 
 
 
183 aa  230  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  55.68 
 
 
177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  59.32 
 
 
178 aa  214  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  57.39 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  40.22 
 
 
182 aa  134  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  31.28 
 
 
178 aa  117  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  41.14 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  32.96 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4517  hypothetical protein  30.73 
 
 
202 aa  111  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  36.36 
 
 
192 aa  111  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  36.41 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  30.73 
 
 
179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  32.78 
 
 
178 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  33.87 
 
 
186 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  32.78 
 
 
189 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  34.43 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  34.43 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  37.5 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  37.36 
 
 
208 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  36.99 
 
 
208 aa  107  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  35.75 
 
 
184 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  33.52 
 
 
199 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  37.5 
 
 
181 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  35.75 
 
 
184 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  34.24 
 
 
186 aa  105  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  38.99 
 
 
197 aa  105  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  34.41 
 
 
191 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  30.51 
 
 
179 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  37.82 
 
 
186 aa  104  6e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  31.84 
 
 
182 aa  104  7e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0211  putative methyltransferase  40.65 
 
 
183 aa  103  1e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.785474  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  31.69 
 
 
188 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  33.7 
 
 
187 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  31.82 
 
 
199 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  37.82 
 
 
189 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  32.24 
 
 
186 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  35.56 
 
 
185 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  32.95 
 
 
194 aa  102  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  35.87 
 
 
193 aa  101  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  31.52 
 
 
210 aa  101  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  39.84 
 
 
182 aa  101  6e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  29.21 
 
 
184 aa  101  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  34.62 
 
 
192 aa  101  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  31.32 
 
 
187 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0565  putative methyltransferase  32.97 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000647034  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  36.67 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  36.41 
 
 
184 aa  98.2  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  32.78 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  32.63 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  40.16 
 
 
205 aa  97.8  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  36.61 
 
 
185 aa  97.8  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  31.49 
 
 
192 aa  97.8  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  32.2 
 
 
203 aa  97.4  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  40.62 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  33.88 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  32.95 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  36.07 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0413  methylase  31.64 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.52 
 
 
199 aa  97.1  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  32.26 
 
 
190 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  33.7 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  33.16 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  34.66 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  35 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  32.95 
 
 
191 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  30.68 
 
 
198 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  31.25 
 
 
198 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  29.55 
 
 
199 aa  95.5  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  31.25 
 
 
198 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  31.52 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  34.29 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  34.29 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  28.89 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6231  hypothetical protein  29.94 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  30.68 
 
 
198 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  30.68 
 
 
198 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  30.68 
 
 
198 aa  94.4  7e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3884  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  32.95 
 
 
207 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3774  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35.62 
 
 
207 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  30.68 
 
 
198 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3764  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35.62 
 
 
207 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3841  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35.62 
 
 
207 aa  94.4  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  42.52 
 
 
193 aa  94.4  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  30.68 
 
 
198 aa  94.4  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  31.25 
 
 
206 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  32.61 
 
 
190 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  30.68 
 
 
198 aa  94  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  32.9 
 
 
184 aa  94  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  33.77 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3943  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35 
 
 
207 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  33.7 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  31.64 
 
 
211 aa  92.8  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  31.69 
 
 
187 aa  92.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09101  N6-adenine-specific methylase  31.66 
 
 
214 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.683798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>