More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5969 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  100 
 
 
188 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  59.24 
 
 
189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  57.07 
 
 
184 aa  191  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  58.51 
 
 
193 aa  190  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  56.04 
 
 
189 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  56.83 
 
 
187 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  56.83 
 
 
187 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  54.59 
 
 
198 aa  177  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  53.51 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  53.85 
 
 
203 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  55.38 
 
 
193 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  53.55 
 
 
188 aa  168  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  53.55 
 
 
184 aa  167  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  53.33 
 
 
174 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  54.89 
 
 
185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  51.89 
 
 
202 aa  164  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  50.83 
 
 
185 aa  164  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  50.27 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  50.82 
 
 
189 aa  157  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  53.63 
 
 
186 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  50 
 
 
191 aa  156  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  52.63 
 
 
175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  52.63 
 
 
175 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  52.63 
 
 
175 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  52.43 
 
 
188 aa  154  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  51.35 
 
 
187 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  56.04 
 
 
185 aa  151  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  50.3 
 
 
174 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  47.25 
 
 
190 aa  147  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  54.45 
 
 
192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  49.74 
 
 
189 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  48.17 
 
 
192 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  48.4 
 
 
204 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  54.26 
 
 
187 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  48.22 
 
 
202 aa  132  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  48.9 
 
 
184 aa  125  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  43.78 
 
 
185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  42.93 
 
 
185 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  40.74 
 
 
187 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  42.86 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  43.89 
 
 
185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  36.56 
 
 
182 aa  109  3e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  43.18 
 
 
191 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  43.41 
 
 
196 aa  108  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  41.94 
 
 
184 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.61 
 
 
191 aa  107  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  38.34 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  40.44 
 
 
193 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  38.59 
 
 
194 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  42.7 
 
 
184 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  42.7 
 
 
184 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  42.86 
 
 
187 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  42.39 
 
 
183 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  41.94 
 
 
184 aa  105  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  36.41 
 
 
194 aa  105  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  41.76 
 
 
190 aa  104  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  37.78 
 
 
192 aa  104  8e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  48.68 
 
 
185 aa  104  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  37.43 
 
 
221 aa  104  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  40.84 
 
 
189 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  45.96 
 
 
180 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  39.9 
 
 
184 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  44.81 
 
 
185 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  39.25 
 
 
191 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  38.95 
 
 
187 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  37.1 
 
 
188 aa  102  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  36.61 
 
 
207 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  34.62 
 
 
199 aa  101  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  34.05 
 
 
188 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  46.75 
 
 
185 aa  101  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  41.21 
 
 
184 aa  101  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.13 
 
 
198 aa  101  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  44.44 
 
 
187 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  39.89 
 
 
193 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  44.44 
 
 
187 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2064  putative methyltransferase  43.33 
 
 
179 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371862  normal  0.712405 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  41.05 
 
 
184 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  36.26 
 
 
215 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.57 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  40.96 
 
 
192 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  37.91 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  37.5 
 
 
191 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  35.71 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  36.6 
 
 
182 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  41.57 
 
 
198 aa  99  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  35.94 
 
 
212 aa  99  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  39.38 
 
 
201 aa  99  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.57 
 
 
198 aa  99  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  41.05 
 
 
184 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
202 aa  99.4  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  47.59 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.57 
 
 
198 aa  99  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.57 
 
 
198 aa  99  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  35.16 
 
 
190 aa  99  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.57 
 
 
198 aa  99  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  52.38 
 
 
179 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  40.88 
 
 
186 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  43.14 
 
 
187 aa  99  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  36.73 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0164  putative methyltransferase  33.9 
 
 
192 aa  98.6  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0357568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>