More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1782 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  384  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  57.61 
 
 
190 aa  214  5e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  58.15 
 
 
190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  55.19 
 
 
186 aa  193  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  50.82 
 
 
186 aa  168  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  48.63 
 
 
183 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  37.7 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  41.3 
 
 
178 aa  117  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  36.07 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.57 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  35.68 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  38.14 
 
 
192 aa  115  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  36.07 
 
 
179 aa  115  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  34.97 
 
 
200 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  38.83 
 
 
191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  34.43 
 
 
200 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  35.14 
 
 
185 aa  112  3e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  35.14 
 
 
200 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  43.09 
 
 
188 aa  111  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  36.61 
 
 
183 aa  111  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  37.7 
 
 
187 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  36.46 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  37.5 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  36.46 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  40.31 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  32.97 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  40.49 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  40.51 
 
 
194 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  32.24 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0465  putative methyltransferase  41.25 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  40.51 
 
 
196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  38.54 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  41.05 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  37.36 
 
 
186 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  36.16 
 
 
211 aa  108  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  43.29 
 
 
180 aa  108  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  39.1 
 
 
186 aa  107  1e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  41.88 
 
 
185 aa  107  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1564  methyltransferase  37.29 
 
 
229 aa  106  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000859592  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  37.89 
 
 
193 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  37.89 
 
 
193 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  42.86 
 
 
187 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  34.81 
 
 
182 aa  105  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  40.85 
 
 
199 aa  105  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  35.33 
 
 
184 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  34.07 
 
 
190 aa  104  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  35.56 
 
 
180 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  38.8 
 
 
187 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  37.5 
 
 
185 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  35.29 
 
 
180 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  35.29 
 
 
180 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  39.38 
 
 
198 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  40.84 
 
 
188 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  36.02 
 
 
212 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  38.04 
 
 
185 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  38.61 
 
 
186 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  39.57 
 
 
197 aa  102  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.75 
 
 
191 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  38.95 
 
 
185 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  34.09 
 
 
228 aa  102  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.38 
 
 
191 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  35.76 
 
 
205 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4178  putative methyltransferase  36.22 
 
 
200 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3506  hypothetical protein  36.87 
 
 
191 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.124416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  35.68 
 
 
198 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  36.02 
 
 
187 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  34.97 
 
 
189 aa  100  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  36.88 
 
 
202 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  40.51 
 
 
186 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  34.81 
 
 
186 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  42.39 
 
 
184 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  36.84 
 
 
187 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0164  putative methyltransferase  36.56 
 
 
192 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0357568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  32.64 
 
 
188 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  41.18 
 
 
185 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  32.64 
 
 
188 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  32.24 
 
 
179 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.65 
 
 
220 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_177  methyltransferase  36.56 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000132935  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  39.63 
 
 
199 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3944  methyltransferase  34.95 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  35.98 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.65 
 
 
220 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  40.11 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  35.87 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  34.78 
 
 
186 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2142  putative methyltransferase  35.23 
 
 
182 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.308596  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  33.33 
 
 
201 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  36.61 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  38.65 
 
 
220 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0189  methyltransferase, putative  36.61 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0820199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  34.97 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  33.16 
 
 
186 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  35 
 
 
183 aa  99  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  35.23 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  32.43 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  38.06 
 
 
192 aa  99.4  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  32.97 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  39.26 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  37.82 
 
 
189 aa  98.6  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>