More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1133 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  100 
 
 		 185 aa  354  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  70.81 
 
 		 185 aa  263  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  58.82 
 
 		 187 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  58.47 
 
 		 189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  56.68 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  58.15 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  58.82 
 
 		 193 aa  191  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  55.49 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  57.3 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  55.43 
 
 		 189 aa  181  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  54.89 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  55.43 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  54.84 
 
 		 188 aa  174  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  53.89 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  54.24 
 
 		 187 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  50.54 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  48.94 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  53.55 
 
 		 185 aa  151  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  48.92 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  54.55 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  51.35 
 
 		 184 aa  145  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  45.74 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  46.28 
 
 		 204 aa  140  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  48.35 
 
 		 190 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  47.47 
 
 		 174 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  48.43 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  50 
 
 		 192 aa  136  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  45.36 
 
 		 203 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  47.03 
 
 		 187 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  48.07 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  47.27 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  47.27 
 
 		 175 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  48.35 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  48.37 
 
 		 185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  46.89 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  46.67 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  48.31 
 
 		 185 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  45.2 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  45.2 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  45.7 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  43.78 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  44.39 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  45.2 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  43.55 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  45.76 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.53 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  44.27 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.53 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  42.86 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  43.85 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  43.89 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  43.75 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  43.89 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  43.65 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  39.01 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  47.09 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  48.88 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  38.46 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  42.68 
 
 		 211 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  38.51 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  40.23 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  38.83 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  46.05 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  34.83 
 
 		 193 aa  111  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  37.7 
 
 		 192 aa  111  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  45.36 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  46.41 
 
 		 188 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  33.88 
 
 		 185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  39.66 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.51 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  45.16 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  43.68 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.8 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  40.66 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0200  methyltransferase  35.8 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044528  decreased coverage  0.00000194399 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  37.29 
 
 		 185 aa  108  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  35.06 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  42.55 
 
 		 180 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  39.01 
 
 		 190 aa  107  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  35 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  46.2 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  40.91 
 
 		 207 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  39.46 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  30.77 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3607  putative methyltransferase  37.08 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  46.45 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  41.24 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  46.2 
 
 		 184 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  42.86 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  37.65 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  39.08 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  37.65 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  41.71 
 
 		 189 aa  104  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  50.4 
 
 		 179 aa  104  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  40.8 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  45.91 
 
 		 180 aa  104  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  39.01 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  45.21 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.66 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>