More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0859 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  100 
 
 		 192 aa  386  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  39.9 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  39.58 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  37.17 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  39.56 
 
 		 193 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  37.02 
 
 		 189 aa  111  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  38.33 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  43.04 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  34.74 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  39.23 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  40.88 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  34.74 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  40.1 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  35.56 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  37.7 
 
 		 185 aa  104  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1564  methyltransferase  36.84 
 
 		 229 aa  104  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000859592  normal  0.334489 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1746  hypothetical protein  35.53 
 
 		 228 aa  104  7e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00357447  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  37.78 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  40.88 
 
 		 184 aa  104  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  38.59 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  39.68 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  36.46 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  37.34 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  37.78 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  36.46 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  36.71 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  33.89 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  34.76 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  35.38 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  40.25 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  34.59 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  38.12 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.86 
 
 		 199 aa  99.8  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2104  putative methyltransferase  37.97 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0220  methyltransferase  37.97 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  40.33 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  36.88 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  31.18 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  36.88 
 
 		 181 aa  99  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  38.04 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  34.22 
 
 		 173 aa  99  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  38.41 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  39.66 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4066  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.86 
 
 		 207 aa  98.2  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  36.22 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  36.84 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  36.56 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  35.08 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  33.7 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  35.67 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  35.87 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.81 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  42.35 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  35.6 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  34.62 
 
 		 186 aa  95.9  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  33.68 
 
 		 201 aa  95.5  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  37.17 
 
 		 180 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  34.24 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  36.6 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  34.72 
 
 		 186 aa  94.4  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  34.44 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  32.96 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  39.53 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  40.61 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  35.29 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  36.17 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  35.68 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  42.31 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  34.12 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  35.45 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  33.85 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0189  methyltransferase, putative  35.56 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0820199  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.71 
 
 		 220 aa  92.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.71 
 
 		 220 aa  92.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  33.52 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  37.63 
 
 		 191 aa  92.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  30.85 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  35.79 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  44.96 
 
 		 180 aa  92.4  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.71 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  37.97 
 
 		 187 aa  92  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  34.34 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  32.6 
 
 		 185 aa  92  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  37.97 
 
 		 188 aa  91.3  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  33.7 
 
 		 185 aa  91.3  8e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  34.38 
 
 		 180 aa  91.3  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  34.38 
 
 		 180 aa  91.3  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  34.24 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  31.41 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  38.74 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  34.21 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  31.91 
 
 		 178 aa  90.9  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  33.33 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  30.63 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  36.27 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0337  hypothetical protein  37.67 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181091  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  31.9 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  31.47 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  37.98 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  36.46 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>