More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0714 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  367  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  87.22 
 
 
180 aa  324  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  87.22 
 
 
180 aa  324  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  52.54 
 
 
188 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  48.57 
 
 
189 aa  168  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  48.6 
 
 
198 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  49.44 
 
 
188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  48.57 
 
 
188 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  48.57 
 
 
188 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  49.14 
 
 
188 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  48 
 
 
188 aa  159  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  47.43 
 
 
188 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  47.43 
 
 
188 aa  156  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  47.43 
 
 
188 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  47.43 
 
 
188 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  47.43 
 
 
188 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  42.86 
 
 
187 aa  143  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  42.68 
 
 
186 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  42.86 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  41.4 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  44.67 
 
 
187 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  41.34 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  41.24 
 
 
184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  40.32 
 
 
178 aa  124  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  45.33 
 
 
210 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  40.33 
 
 
192 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  40.34 
 
 
179 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  40.45 
 
 
184 aa  122  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  41.57 
 
 
207 aa  121  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  37.78 
 
 
187 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  38.37 
 
 
184 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  40 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  40.45 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  37.63 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1260  N6-adenine-specific methylase  38.38 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  36.07 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  36.57 
 
 
184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  35.56 
 
 
186 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  38.67 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  34.18 
 
 
183 aa  117  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  41.14 
 
 
189 aa  117  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  37.71 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  43.42 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.57 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  37.91 
 
 
193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  35.85 
 
 
191 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  42.68 
 
 
185 aa  111  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  42.68 
 
 
185 aa  111  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  38.75 
 
 
193 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  36.72 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  40 
 
 
189 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  38.16 
 
 
187 aa  108  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  34.78 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  34.78 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  36.42 
 
 
192 aa  107  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  37.85 
 
 
187 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  37.34 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  37.97 
 
 
180 aa  107  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  33.33 
 
 
187 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  34.74 
 
 
190 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  33.15 
 
 
178 aa  104  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  37.11 
 
 
186 aa  104  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  34.59 
 
 
183 aa  103  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  36.02 
 
 
184 aa  103  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  32.37 
 
 
187 aa  103  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  34.62 
 
 
190 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  36.42 
 
 
191 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  39.33 
 
 
200 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  33.71 
 
 
207 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  30.98 
 
 
183 aa  101  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  38.92 
 
 
186 aa  101  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1395  putative methyltransferase  34.83 
 
 
175 aa  101  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1441  methyltransferase  34.83 
 
 
175 aa  101  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  38 
 
 
200 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  33.51 
 
 
198 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  34.22 
 
 
187 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  37.91 
 
 
188 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  31.89 
 
 
191 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  32.62 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1932  hypothetical protein  40.14 
 
 
205 aa  99.4  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.007587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  34.25 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1433  putative methyltransferase  31.15 
 
 
195 aa  99.4  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  38 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  33.71 
 
 
185 aa  99  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  38 
 
 
200 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  33.7 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  33.51 
 
 
185 aa  99  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  33.52 
 
 
185 aa  99  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  35.08 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  34.78 
 
 
192 aa  98.6  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  35.48 
 
 
189 aa  98.2  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  35.12 
 
 
201 aa  98.2  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  34.92 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  34.27 
 
 
185 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  36.02 
 
 
196 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  34.05 
 
 
185 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  36.6 
 
 
184 aa  97.8  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  36.77 
 
 
190 aa  97.4  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  32.93 
 
 
197 aa  97.1  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  28.49 
 
 
186 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0722721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>