More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0172 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  69.15 
 
 		 190 aa  257  8e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  58.15 
 
 		 189 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  58.15 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  54.59 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  48.68 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.82 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  37.3 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  42.49 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  43.56 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  33.51 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  44.09 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  43.68 
 
 		 198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  41.18 
 
 		 180 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  35.79 
 
 		 185 aa  115  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  44.21 
 
 		 188 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  40 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  40 
 
 		 185 aa  114  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  34.05 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  37.57 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  43.85 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  34.78 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  47.1 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  41.61 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  40.21 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  37.8 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  36.7 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  44.23 
 
 		 180 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  40.11 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  35.98 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  40.1 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  36.65 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  41.51 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  45.41 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0653  hypothetical protein  40.1 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  44.44 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  38.54 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  38.22 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  42.04 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  35.33 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  40.25 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  34.57 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  39.79 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  32.26 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  42.68 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  35.48 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  35.11 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  40.74 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  41.92 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  34.57 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  35.33 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  34.76 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  39.69 
 
 		 193 aa  106  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  37.76 
 
 		 187 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  39.79 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  44.44 
 
 		 187 aa  106  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  41.4 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  41.4 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  38.95 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  38.38 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  40.74 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.72 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0218  putative methyltransferase  38.71 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  37.37 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  41.76 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  39.69 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  39.29 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4754  hypothetical protein  40.91 
 
 		 196 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.953228  normal  0.0433742 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  42.41 
 
 		 192 aa  104  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  38.04 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  39.13 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  46.88 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  42.5 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  46.88 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  33.87 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  40.65 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  42.04 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  43.59 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  38.51 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  39.58 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3869  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  42.86 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.673493  normal  0.0927099 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  40.64 
 
 		 173 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  36.56 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0065  methyltransferase, putative  40 
 
 		 188 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  42.41 
 
 		 193 aa  101  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  40.65 
 
 		 200 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  40.25 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  42.78 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  36.94 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.1 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.94 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.1 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.1 
 
 		 198 aa  100  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  41.1 
 
 		 198 aa  100  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>