More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1108 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  366  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  61.36 
 
 
182 aa  237  6.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  55.68 
 
 
184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  55.11 
 
 
178 aa  211  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  53.98 
 
 
178 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  53.98 
 
 
178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  48.86 
 
 
183 aa  189  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4517  hypothetical protein  34.27 
 
 
202 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  34.08 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  35.03 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  34.05 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  33.15 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  35.23 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  35.23 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0852  methyltransferase, putative  32.02 
 
 
182 aa  103  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  36.77 
 
 
185 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  32.58 
 
 
178 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  32.02 
 
 
182 aa  102  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  43.55 
 
 
182 aa  102  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  34.64 
 
 
184 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  34.07 
 
 
198 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  35.95 
 
 
186 aa  101  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  34.59 
 
 
190 aa  101  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  32.24 
 
 
187 aa  100  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  35.03 
 
 
186 aa  100  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  30.05 
 
 
186 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  34.09 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0211  putative methyltransferase  40.65 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.785474  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  36.31 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  32.04 
 
 
185 aa  99  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  33.15 
 
 
210 aa  98.2  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  97.8  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  34.41 
 
 
191 aa  97.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  32.7 
 
 
189 aa  97.4  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  33.76 
 
 
185 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  27.53 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  28.98 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  32.07 
 
 
194 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  30 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  35.26 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  31.55 
 
 
189 aa  95.1  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  35.98 
 
 
191 aa  94.7  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  30.73 
 
 
179 aa  93.6  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  30.9 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  30.77 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  32.79 
 
 
186 aa  93.6  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  30.38 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  34.19 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  32.9 
 
 
188 aa  92.8  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  31.32 
 
 
189 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  31.89 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  31.89 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3747  putative methyltransferase  31.64 
 
 
211 aa  92.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  33.87 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  31.15 
 
 
186 aa  92  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  38.21 
 
 
185 aa  92  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  30.43 
 
 
185 aa  92  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  37.5 
 
 
191 aa  92  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  33.55 
 
 
188 aa  92  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  32.42 
 
 
193 aa  91.7  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  32.9 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  33.55 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  33.55 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  33.55 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  33.55 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  33.55 
 
 
188 aa  91.7  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0906  hypothetical protein  36.72 
 
 
188 aa  91.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.273789  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  30.77 
 
 
186 aa  91.3  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  32.9 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  29.89 
 
 
183 aa  90.9  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  34.84 
 
 
185 aa  90.9  9e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  28.09 
 
 
199 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  32.9 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  31.52 
 
 
188 aa  90.1  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  32.26 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  29.12 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0441  hypothetical protein  32.79 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  29.52 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  37.4 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  39.2 
 
 
208 aa  89.4  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  34.53 
 
 
184 aa  89  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  31.35 
 
 
207 aa  89.4  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  30 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0565  putative methyltransferase  34.21 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000647034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  29.7 
 
 
184 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  39.2 
 
 
208 aa  89  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1549  methyltransferase  32.42 
 
 
192 aa  89  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0871501  normal  0.284169 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0307  methyltransferase  32.8 
 
 
226 aa  89  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499795  hitchhiker  0.00000453618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  33.15 
 
 
184 aa  88.2  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  30.94 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  32.74 
 
 
205 aa  88.2  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  31.18 
 
 
198 aa  88.2  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  32.45 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  27.84 
 
 
199 aa  87.8  8e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0285  hypothetical protein  32.2 
 
 
191 aa  87.4  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.119665  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  29.79 
 
 
187 aa  87.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  30.05 
 
 
184 aa  87.4  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  30.19 
 
 
187 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>