More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3033 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  100 
 
 
185 aa  368  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  100 
 
 
185 aa  368  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  43.65 
 
 
184 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  38.46 
 
 
210 aa  145  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  37.84 
 
 
186 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  43.72 
 
 
207 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  39.23 
 
 
183 aa  141  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  45.11 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  42.16 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  37.16 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  41.4 
 
 
207 aa  137  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  40.54 
 
 
183 aa  138  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  35.36 
 
 
184 aa  135  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  41.58 
 
 
194 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  44.2 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  43.65 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  44.15 
 
 
185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  44.75 
 
 
189 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  37.91 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  37.36 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  42.39 
 
 
180 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  35.36 
 
 
183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  41.08 
 
 
193 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  42.47 
 
 
193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  36.26 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  36.46 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  36.46 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  41.44 
 
 
178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  40.54 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  45.83 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  43.55 
 
 
191 aa  125  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  36.26 
 
 
188 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  38.8 
 
 
187 aa  124  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  35.71 
 
 
188 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  35.71 
 
 
188 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  35.71 
 
 
188 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  35.71 
 
 
188 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  35.16 
 
 
188 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  35.71 
 
 
188 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  36.81 
 
 
189 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  42.02 
 
 
186 aa  122  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  36.76 
 
 
179 aa  122  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  39.25 
 
 
189 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1433  putative methyltransferase  34.2 
 
 
195 aa  121  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.525035 
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  47.15 
 
 
186 aa  121  7e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  41.18 
 
 
186 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  43.81 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  45.11 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  39.36 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  37.36 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  35.87 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  36.81 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  44.57 
 
 
187 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  44.57 
 
 
187 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  33.88 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0478  methyltransferase  40.64 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.742693  normal  0.414709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  44.69 
 
 
180 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3005  putative methyltransferase  40.21 
 
 
184 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.297488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  43.32 
 
 
185 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  44.85 
 
 
208 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  41.48 
 
 
208 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  42.78 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  41.24 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  42.47 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  43.18 
 
 
205 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  42.41 
 
 
198 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  40.11 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  40.64 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  36.41 
 
 
179 aa  115  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  35.36 
 
 
188 aa  114  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  40 
 
 
190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  42.78 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  38.89 
 
 
200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  40.32 
 
 
187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  34.92 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  34.92 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  40.54 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  34.92 
 
 
220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1947  hypothetical protein  39.2 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  41.4 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0901  N-6 adenine-specific DNA methylase  41.27 
 
 
184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2560  putative methyltransferase  40.74 
 
 
184 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776175  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  43.37 
 
 
197 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1260  N6-adenine-specific methylase  32.8 
 
 
186 aa  112  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  39.66 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.96 
 
 
191 aa  111  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.96 
 
 
191 aa  111  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  37.7 
 
 
205 aa  111  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  43.41 
 
 
179 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  43.41 
 
 
179 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  36.07 
 
 
178 aa  111  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  44.44 
 
 
184 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  33.69 
 
 
185 aa  111  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  36.96 
 
 
199 aa  110  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  43.41 
 
 
179 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  39.56 
 
 
177 aa  110  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  44.62 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  35.33 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  34.62 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  42.47 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>