More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2465 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  380  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  71.75 
 
 		 179 aa  267  8e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  68.36 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  48.9 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  47.25 
 
 		 184 aa  177  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  48.35 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  47.8 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  47.8 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  47.8 
 
 		 188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  47.8 
 
 		 188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  47.8 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  46.96 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  47.25 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  47.25 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  47.25 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  47.25 
 
 		 188 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  47.25 
 
 		 188 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  43.96 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  42.31 
 
 		 189 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1260  N6-adenine-specific methylase  45.45 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  42.7 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  40.11 
 
 		 184 aa  144  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  39.01 
 
 		 210 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  43.43 
 
 		 180 aa  134  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  37.64 
 
 		 179 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  38.2 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  37.7 
 
 		 189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2204  methyltransferase  37.08 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.22758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  37.08 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  38.67 
 
 		 180 aa  118  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  42.68 
 
 		 180 aa  117  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  42.68 
 
 		 180 aa  117  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  35.71 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  36.65 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  38.38 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  35.33 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  35.36 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  35.36 
 
 		 185 aa  114  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  31.67 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  35.71 
 
 		 187 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  35.71 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  38.33 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  34.76 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  37.99 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  37.36 
 
 		 191 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  33.87 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2064  putative methyltransferase  37.99 
 
 		 179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0371862  normal  0.712405 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  37.43 
 
 		 188 aa  112  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_002936  DET0189  methyltransferase, putative  32.58 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0820199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0092  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.9 
 
 		 191 aa  111  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  35.87 
 
 		 186 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  40.54 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  32.6 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  32.2 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0098  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.9 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_177  methyltransferase  32.02 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000132935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  41.94 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  31.69 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  34.78 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  38.76 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  34.78 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  31.69 
 
 		 200 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  38.2 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3980  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.53 
 
 		 220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0238  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.53 
 
 		 220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0164  putative methyltransferase  32.02 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0357568  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  31.69 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  32.61 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0576  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  33.53 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.359353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  35.36 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  36.81 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  37.02 
 
 		 183 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  38.55 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  32.07 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  34.25 
 
 		 187 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0156  putative methyltransferase  37.04 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  36.65 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  34.97 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  33.15 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  35.33 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  35.16 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  30.34 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  36.07 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4018  hypothetical protein  35.47 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  32.75 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  39.01 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  36.07 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3857  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  30.34 
 
 		 198 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0115  putative methyltransferase  35.29 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  35.14 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  37.57 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0250  methyltransferase  30.34 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4785  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  30.34 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3947  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  30.34 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3748  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  30.34 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0251  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  30.34 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  37.02 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1881  methyltransferase, putative  33.9 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.752838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0424  methyltransferase, putative  31.84 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  31.07 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>