More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1808 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  100 
 
 
191 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  85.11 
 
 
205 aa  330  7.000000000000001e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  70.49 
 
 
192 aa  255  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  53.26 
 
 
191 aa  214  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  47.31 
 
 
189 aa  169  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  38.25 
 
 
210 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0189  methyltransferase, putative  36.67 
 
 
192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0820199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  40.11 
 
 
189 aa  131  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0164  putative methyltransferase  36.11 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0357568  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_177  methyltransferase  36.11 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000132935  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  38.25 
 
 
184 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  38.12 
 
 
189 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  40.64 
 
 
187 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  40.11 
 
 
183 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  37.1 
 
 
188 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  36.61 
 
 
186 aa  124  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  36.56 
 
 
188 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  36.46 
 
 
198 aa  122  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  36.56 
 
 
188 aa  121  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  42 
 
 
187 aa  120  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  36.56 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  36.56 
 
 
188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  36.7 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  36.02 
 
 
188 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  36.02 
 
 
188 aa  118  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  36.02 
 
 
188 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  36.02 
 
 
188 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  36.02 
 
 
188 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  39.25 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  38.33 
 
 
184 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  37.36 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  35.16 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  40.13 
 
 
178 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  40.43 
 
 
188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  37.71 
 
 
180 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  40.37 
 
 
183 aa  112  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  36.31 
 
 
187 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  35.85 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  35.48 
 
 
193 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  37.16 
 
 
185 aa  111  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  37.16 
 
 
185 aa  111  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  35.16 
 
 
179 aa  110  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  36.67 
 
 
193 aa  110  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  34.32 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  34.32 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  40 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  31.18 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  36.07 
 
 
187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  33.51 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  35.43 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  41.11 
 
 
193 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  34.41 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  32.79 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  32.79 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  33.87 
 
 
207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  39.44 
 
 
189 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  36.22 
 
 
191 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10010  putative methyltransferase  42.86 
 
 
201 aa  106  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000171171  hitchhiker  0.00000036703 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  35.71 
 
 
179 aa  106  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.91 
 
 
194 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  36.02 
 
 
187 aa  104  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  34.64 
 
 
187 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1543  methyltransferase  35.2 
 
 
212 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  34.68 
 
 
185 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1260  N6-adenine-specific methylase  38.93 
 
 
186 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  35.16 
 
 
182 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  36.87 
 
 
188 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  36.25 
 
 
178 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  35.16 
 
 
184 aa  101  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  38.06 
 
 
186 aa  101  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  37.93 
 
 
185 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  36.26 
 
 
179 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  33.51 
 
 
191 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4517  hypothetical protein  33.68 
 
 
202 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  35.87 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  34.05 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  39.38 
 
 
190 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  36.99 
 
 
183 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  35.67 
 
 
192 aa  98.6  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  33.96 
 
 
178 aa  99  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  34.76 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  34.76 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  37.75 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  34.72 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  33.33 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  31.68 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  37.29 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  32.07 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  38.61 
 
 
202 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  37.99 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0307  methyltransferase  35.68 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499795  hitchhiker  0.00000453618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  36.31 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  33.51 
 
 
185 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  34.2 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  35.98 
 
 
177 aa  94.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  37.63 
 
 
187 aa  94.4  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  32.58 
 
 
189 aa  94.7  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  43.41 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  31.01 
 
 
183 aa  94  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  38.46 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>