More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1983 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  100 
 
 
185 aa  379  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  99.46 
 
 
185 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  37.7 
 
 
186 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  38.33 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  36.46 
 
 
187 aa  136  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  37.91 
 
 
184 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  35.52 
 
 
210 aa  134  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  36.9 
 
 
207 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  36.41 
 
 
180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2441  methyltransferase  34.25 
 
 
183 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.585429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  35.52 
 
 
188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  39.78 
 
 
178 aa  127  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  35.52 
 
 
188 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  35.36 
 
 
189 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  36.07 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  36.22 
 
 
198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  34.78 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  34.97 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  34.43 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  36.36 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  34.97 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  34.43 
 
 
188 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  34.43 
 
 
188 aa  124  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  34.43 
 
 
188 aa  124  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  34.43 
 
 
188 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  41.4 
 
 
180 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  41.4 
 
 
180 aa  124  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  35.33 
 
 
207 aa  124  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  37.63 
 
 
189 aa  124  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  34.43 
 
 
188 aa  124  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  36.61 
 
 
187 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  42.68 
 
 
180 aa  123  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  35.87 
 
 
188 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  36.26 
 
 
185 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  36.26 
 
 
185 aa  122  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  33.33 
 
 
188 aa  123  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  36.41 
 
 
187 aa  122  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0618  methyltransferase  32.6 
 
 
183 aa  122  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  37.57 
 
 
184 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  36.76 
 
 
192 aa  121  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  35.29 
 
 
191 aa  121  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  36.36 
 
 
193 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.77 
 
 
194 aa  120  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  35.83 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  35.91 
 
 
199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  34.05 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  30.98 
 
 
187 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  35.83 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  35.83 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  37.16 
 
 
185 aa  115  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  37.02 
 
 
188 aa  114  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  34.95 
 
 
185 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  36.61 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  37.16 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  37.3 
 
 
185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  34.76 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  36.67 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  35.11 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1260  N6-adenine-specific methylase  39.61 
 
 
186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  34.64 
 
 
199 aa  112  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5164  methyltransferase  33.7 
 
 
200 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  34.76 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4987  putative methyltransferase  33.7 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  34.25 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5114  hypothetical protein  33.7 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0351  methyltransferase  33.7 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  36.17 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  38.31 
 
 
187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5340  hypothetical protein  34.07 
 
 
202 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  32.95 
 
 
205 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  34.22 
 
 
185 aa  108  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  32.79 
 
 
191 aa  108  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3943  putative methyltransferase  34.07 
 
 
194 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00817636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  36.32 
 
 
186 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  33.15 
 
 
192 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  36.11 
 
 
179 aa  108  6e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  35.36 
 
 
181 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0117  hypothetical protein  32.61 
 
 
186 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03510  methyltransferase  33.7 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0889204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3664  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  34.43 
 
 
198 aa  107  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04860  putative methyltransferase  33.52 
 
 
198 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  36.11 
 
 
179 aa  107  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  34.76 
 
 
185 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  37.84 
 
 
185 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  33.71 
 
 
186 aa  106  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  35.91 
 
 
181 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  34.05 
 
 
189 aa  106  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0189  methyltransferase, putative  30.77 
 
 
192 aa  105  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0820199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  30.65 
 
 
205 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0164  putative methyltransferase  30.77 
 
 
192 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0357568  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3170  hypothetical protein  38.16 
 
 
184 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293392  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0307  methyltransferase  35.29 
 
 
226 aa  105  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499795  hitchhiker  0.00000453618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0907  hypothetical protein  34.24 
 
 
186 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03314  predicted methyltransferase  34.43 
 
 
198 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1357  methyltransferase  32.98 
 
 
188 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  34.43 
 
 
178 aa  105  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03267  hypothetical protein  34.43 
 
 
198 aa  105  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  36.61 
 
 
184 aa  104  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  33.51 
 
 
184 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4330  putative methyltransferase  33.7 
 
 
200 aa  104  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>