More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1990 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  100 
 
 
175 aa  341  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  99.43 
 
 
175 aa  338  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  67.68 
 
 
174 aa  213  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  61.9 
 
 
188 aa  202  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4197  putative methyltransferase  62.42 
 
 
174 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  52.63 
 
 
188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  54.71 
 
 
186 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  53.05 
 
 
187 aa  148  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  48.81 
 
 
187 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  51.15 
 
 
198 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  50.61 
 
 
187 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  53.89 
 
 
193 aa  141  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  48.52 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  49.38 
 
 
189 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  47.4 
 
 
193 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  45.45 
 
 
202 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  44.38 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  46.95 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  50 
 
 
188 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  45.61 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  46.88 
 
 
189 aa  125  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  46.67 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  47.53 
 
 
185 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  46.91 
 
 
186 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  47.31 
 
 
189 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10830  putative methyltransferase  44.51 
 
 
202 aa  112  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.000726134  normal  0.125771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  44.38 
 
 
203 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  35.43 
 
 
188 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  35.43 
 
 
188 aa  110  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  35.43 
 
 
188 aa  110  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  35.43 
 
 
188 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  35.43 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2278  methyltransferase  42.11 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  34.86 
 
 
188 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  34.86 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  34.86 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  43.35 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  59.63 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  43.2 
 
 
184 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1579  putative methyltransferase  40.83 
 
 
190 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.864344  normal  0.0745761 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  34.86 
 
 
188 aa  104  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  34.86 
 
 
188 aa  104  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  46.75 
 
 
173 aa  104  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0321  RNA methyltransferase, RsmD family  40.61 
 
 
194 aa  103  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.657175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  40.48 
 
 
185 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  50 
 
 
182 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  44.38 
 
 
185 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  44.38 
 
 
185 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  40.11 
 
 
187 aa  101  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  43.78 
 
 
191 aa  100  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  42.6 
 
 
184 aa  100  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  40.11 
 
 
192 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4587  hypothetical protein  35.67 
 
 
190 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  42.6 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  53.85 
 
 
180 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1371  putative methyltransferase  47.31 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0236925  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4095  methyltransferase  35.93 
 
 
222 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0170  putative methyltransferase  35.93 
 
 
222 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.160078  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2378  methyltransferase  36.69 
 
 
190 aa  99  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0432651  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  41.61 
 
 
207 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  44.91 
 
 
187 aa  99  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2990  hypothetical protein  49.59 
 
 
228 aa  99  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188933  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0288  putative methyltransferase  36.9 
 
 
221 aa  99  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0925066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4165  putative methyltransferase  35.93 
 
 
222 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484142  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  40.78 
 
 
204 aa  98.6  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  36.78 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  43.02 
 
 
177 aa  98.6  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3848  putative methyltransferase  35.54 
 
 
215 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.493738  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  41.21 
 
 
185 aa  97.4  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  35.84 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  39.33 
 
 
189 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  35.47 
 
 
198 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  37.95 
 
 
187 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  37.95 
 
 
187 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  44.83 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  33.71 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3973  putative methyltransferase  34.5 
 
 
215 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  40 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3775  putative methyltransferase  35.54 
 
 
215 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526648  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  36.71 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4296  putative methyltransferase  35.54 
 
 
222 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0347718  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  37.35 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  38.32 
 
 
184 aa  94.7  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  94.4  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  32.94 
 
 
183 aa  94  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  40.96 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  41.95 
 
 
189 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  35.37 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  40.83 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  38.82 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  37.42 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  35.47 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  38.79 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  40.83 
 
 
197 aa  92.8  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  34.5 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  34.15 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  34.15 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  36.47 
 
 
191 aa  91.7  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0274  putative methyltransferase  35.5 
 
 
199 aa  91.7  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.569214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>