More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1372 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  378  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  61.36 
 
 
177 aa  237  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  60.8 
 
 
178 aa  225  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  57.39 
 
 
184 aa  213  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  55.11 
 
 
178 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  53.89 
 
 
183 aa  201  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  53.98 
 
 
178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  33.33 
 
 
178 aa  122  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  33.9 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4517  hypothetical protein  31.11 
 
 
202 aa  111  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6590  methyltransferase  34.24 
 
 
185 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0068  methyltransferase  37.91 
 
 
185 aa  104  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  32.8 
 
 
198 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  31.32 
 
 
184 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  29.78 
 
 
179 aa  102  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  33.15 
 
 
186 aa  101  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  35.64 
 
 
186 aa  100  8e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3860  methyltransferase  36.67 
 
 
184 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  30.68 
 
 
179 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  30.6 
 
 
182 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4169  methyltransferase  36.67 
 
 
184 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.6354 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  33.15 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  33.15 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  35.2 
 
 
184 aa  99  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  32.82 
 
 
194 aa  98.6  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  30.9 
 
 
178 aa  97.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  32.09 
 
 
210 aa  97.1  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  35.48 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  35.48 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  32.61 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6054  methyltransferase  34.24 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.345289  normal  0.293014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  33.86 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  36.41 
 
 
198 aa  95.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  32.97 
 
 
191 aa  94.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  31.68 
 
 
187 aa  94.4  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  41.46 
 
 
173 aa  94.4  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00281  N6-adenine-specific methylase  28.42 
 
 
199 aa  93.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  30.6 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  32.61 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  29.44 
 
 
199 aa  92.8  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  31.32 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  34.5 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  32.45 
 
 
191 aa  92.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  34.5 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  34.5 
 
 
175 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0182  hypothetical protein  34.16 
 
 
157 aa  91.7  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  28.65 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  39.47 
 
 
191 aa  90.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  29.73 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  33.69 
 
 
207 aa  90.5  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  31.22 
 
 
190 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  31.33 
 
 
185 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  38.4 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05600  putative methyltransferase  34.05 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0267  methyltransferase  31.69 
 
 
208 aa  89.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  31.02 
 
 
189 aa  89  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1676  methyltransferase  33.16 
 
 
186 aa  89.4  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  27.57 
 
 
188 aa  89  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  28.11 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  35.29 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2549  hypothetical protein  33.77 
 
 
184 aa  89  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.059553  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  33.14 
 
 
187 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  28.88 
 
 
187 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0211  putative methyltransferase  38.1 
 
 
183 aa  88.6  5e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.785474  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  31.25 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  30.92 
 
 
181 aa  88.2  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  30.92 
 
 
181 aa  88.2  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  30.49 
 
 
187 aa  87.8  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2034  methyltransferase  32.6 
 
 
183 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1702  putative methyltransferase  32.47 
 
 
184 aa  87.8  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.49519  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0297  putative methylase  31.15 
 
 
208 aa  87.8  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  27.57 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00312  putative methyltransferase  30.73 
 
 
228 aa  87.8  8e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  38.28 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  27.03 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  32.46 
 
 
190 aa  87  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  27.57 
 
 
188 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  27.57 
 
 
188 aa  87  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  27.57 
 
 
188 aa  87  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  27.57 
 
 
188 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  27.57 
 
 
188 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  28.65 
 
 
189 aa  87  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  29.89 
 
 
199 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  32.26 
 
 
189 aa  87  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  38.71 
 
 
180 aa  87  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  31.55 
 
 
184 aa  87  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  36.03 
 
 
182 aa  86.3  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  33.68 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  32.26 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  32.39 
 
 
197 aa  86.3  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  28.65 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0389  hypothetical protein  41.94 
 
 
215 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  32.7 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  31.15 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  29.73 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  41.03 
 
 
184 aa  85.5  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  37.42 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2067  methyltransferase  31.87 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  33.16 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2819  methyltransferase  37.58 
 
 
204 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528712  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>