More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1989 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  58.19 
 
 
178 aa  227  8e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4517  hypothetical protein  53.3 
 
 
202 aa  201  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  51.96 
 
 
179 aa  184  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  38.89 
 
 
179 aa  134  8e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  36.31 
 
 
178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6231  hypothetical protein  39.56 
 
 
183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  33.52 
 
 
183 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  35.75 
 
 
178 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  35.56 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  32.96 
 
 
184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  33.89 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  36.46 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  32.02 
 
 
177 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  30.6 
 
 
182 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  36.02 
 
 
186 aa  99  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  38.96 
 
 
184 aa  99  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  31.11 
 
 
186 aa  98.2  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  37.35 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0182  hypothetical protein  38.41 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  35.6 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  39.47 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  34.05 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  36.36 
 
 
207 aa  94.4  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  33.68 
 
 
191 aa  94.4  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  31.38 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  36.14 
 
 
198 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  34.76 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  32.81 
 
 
205 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  33.88 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  31.89 
 
 
184 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  31.38 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1760  hypothetical protein  32.62 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750881  normal  0.0782311 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  32.6 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  30.46 
 
 
189 aa  91.7  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1368  hypothetical protein  34.15 
 
 
142 aa  91.3  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1673  methyltransferase  30.6 
 
 
191 aa  90.9  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00132655  normal  0.0102271 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2317  methyltransferase  38.1 
 
 
193 aa  90.9  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  30.11 
 
 
186 aa  90.9  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  38.1 
 
 
193 aa  90.5  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  34.59 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0285  hypothetical protein  28.89 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.119665  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  35.79 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1604  methyltransferase  30.25 
 
 
187 aa  89  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.169342  normal  0.911119 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  31.76 
 
 
193 aa  88.6  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  32.81 
 
 
207 aa  88.6  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  29.35 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  30.11 
 
 
198 aa  88.2  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  29.61 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1878  methyltransferase  27.32 
 
 
189 aa  87.4  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.0169858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  34.43 
 
 
177 aa  87.4  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  31.18 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  32.11 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  29.73 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  31.4 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  31.18 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  31.4 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  32.98 
 
 
188 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  32.98 
 
 
188 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  32.98 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  32.98 
 
 
188 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  32.98 
 
 
188 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0211  putative methyltransferase  36 
 
 
183 aa  85.9  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.785474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  27.51 
 
 
188 aa  85.9  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  30.97 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  33.51 
 
 
210 aa  85.5  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  32.46 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  36.7 
 
 
194 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  36 
 
 
182 aa  85.1  5e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  32.46 
 
 
188 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  33.86 
 
 
184 aa  84.7  6e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0189  methyltransferase, putative  27.08 
 
 
192 aa  84.3  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0820199  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  30.56 
 
 
184 aa  84.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  36.93 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  27.72 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  32.12 
 
 
187 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  33.33 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  36.93 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  31.41 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  32.48 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  29.17 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0201  putative methyltransferase  31.32 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0416143  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0475  methyltransferase  31.79 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.576019  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  33.33 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0523  methyltransferase  30.85 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  37.06 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4320  methyltransferase  30.06 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29385  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  29.89 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  33.51 
 
 
182 aa  82.4  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  27.6 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0164  putative methyltransferase  28.42 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0357568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  31.94 
 
 
188 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  33.16 
 
 
204 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  29.32 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  32.45 
 
 
185 aa  82  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  32.45 
 
 
185 aa  82  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0936  methyltransferase small  31.94 
 
 
192 aa  82  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000732019  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  27.95 
 
 
185 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  32.26 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>