More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6231 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6231  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4517  hypothetical protein  40.11 
 
 		 202 aa  150  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1300  hypothetical protein  41.34 
 
 		 179 aa  137  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10608  putative methyltransferase  38.98 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1989  hypothetical protein  39.56 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1467  hypothetical protein  39.2 
 
 		 179 aa  131  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  36.67 
 
 		 182 aa  110  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1191  hypothetical protein  34.46 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.394589 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1191  hypothetical protein  28.81 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0176864  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1438  hypothetical protein  29.94 
 
 		 184 aa  94.7  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  32.45 
 
 		 187 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3619  methyltransferase  35.33 
 
 		 179 aa  91.3  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1016  hypothetical protein  29.38 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1108  hypothetical protein  28.85 
 
 		 177 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1185  hypothetical protein  28.18 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  27.93 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2727  hypothetical protein  30.51 
 
 		 181 aa  85.9  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  27.93 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  31.61 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2600  hypothetical protein  33.11 
 
 		 181 aa  84.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1372  hypothetical protein  27.5 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1226  methyltransferase  32.22 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  32.26 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2609  putative methyltransferase  30.6 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  36 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1372  hypothetical protein  33.51 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.196321  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  33.15 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0739  putative methyltransferase  32.79 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  37.3 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  31.15 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3722  hypothetical protein  35.77 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.106006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  33.16 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  31.15 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0285  hypothetical protein  29.51 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.119665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  33.16 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  31.35 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1368  hypothetical protein  32.08 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  34.67 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  32.24 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  37.9 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  31.72 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  30.41 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1133  putative methyltransferase  28.49 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377583  normal  0.0222442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  28.66 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  28.11 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2985  putative methyltransferase  34.15 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2740  putative methyltransferase  29.57 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.695102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0774  hypothetical protein  28.19 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1281  putative methyltransferase  28.18 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0859  methyltransferase  29.17 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0182  hypothetical protein  32.5 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1649  methyltransferase  28.18 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1563  methyltransferase  30.94 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.388712  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  30.77 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0172  methyltransferase  35.38 
 
 		 190 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000370992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  29.47 
 
 		 187 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1070  hypothetical protein  27.78 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2499  putative methyltransferase  37.8 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2246  methyltransferase  29.89 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000301604 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  32.42 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1600  putative methyltransferase  28.04 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  30.81 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  28.18 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2301  methyltransferase  28.42 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  28.42 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2840  methyltransferase  35.77 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.964811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  27.07 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2656  putative methyltransferase  28.57 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1808  putative methyltransferase  29.12 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  29.73 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  28.85 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2992  methyltransferase  28.02 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.094334  hitchhiker  0.00866614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  31.25 
 
 		 191 aa  72  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  30.11 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  32.89 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2375  hypothetical protein  25.54 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0161405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12981  methyltransferase  29.57 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  30.98 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0736  hypothetical protein  33.61 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  30.43 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1592  N6-adenine-specific methylase  30.16 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0819075  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3517  putative methyltransferase  34.96 
 
 		 207 aa  70.9  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1925  putative methyltransferase  33.56 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  29.19 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  31.22 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11651  N6-adenine-specific methylase  28.28 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0622  putative methyltransferase  31.87 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1244  methyltransferase, putative  27.81 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  29.19 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.780238  hitchhiker  0.0081825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1782  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.849999  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2735  hypothetical protein  32.79 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.812643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0220  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  25.54 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0403675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  30.73 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  28.8 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  30.56 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3878  16S rRNA m(2)G966-methyltransferase  25.97 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  29.19 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  34.65 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>