More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0056 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0056  methyltransferase  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0999  methyltransferase  41.27 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000716702  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1178  N6-adenine-specific methylase  28.5 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000285782  hitchhiker  0.000323069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1881  methyltransferase  40.6 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.524785  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2633  putative methyltransferase  33.14 
 
 		 188 aa  98.2  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000213912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2008  methyltransferase  45.8 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0520777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4031  putative methyltransferase  38.71 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.10166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3977  methyltransferase, putative  37.9 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.139787  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  39.52 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4042  putative methyltransferase  37.9 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000011636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1208  putative methyltransferase  38.71 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.101765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1614  methyltransferase, putative  33.54 
 
 		 179 aa  96.3  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000479441  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0452  type II DNA modification methyltransferase, putative  41.13 
 
 		 179 aa  95.9  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0503745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1167  methyltransferase  41.98 
 
 		 183 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.46316 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3842  methyltransferase  37.9 
 
 		 188 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3689  methyltransferase  37.9 
 
 		 188 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0444848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3945  putative methyltransferase  37.9 
 
 		 188 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4140  methyltransferase  37.9 
 
 		 188 aa  95.5  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3672  methyltransferase  37.9 
 
 		 188 aa  95.5  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0162656  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1209  putative methyltransferase  37.02 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.211028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18420  putative methyltransferase  35.68 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2704  putative methyltransferase  44.88 
 
 		 173 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00108888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1770  methyltransferase  37.97 
 
 		 189 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00583813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3757  putative methyltransferase  37.1 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0640  putative methyltransferase  32.93 
 
 		 187 aa  94.4  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000429938  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0429  putative methyltransferase  35.6 
 
 		 186 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10130  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0668622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4642  methyltransferase  39.69 
 
 		 187 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.471552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2191  putative methyltransferase  41.09 
 
 		 187 aa  92.8  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000224666  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1296  hypothetical protein  45.67 
 
 		 180 aa  92.4  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3830  methyltransferase  39.52 
 
 		 180 aa  91.3  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264244  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0207  hypothetical protein  36.04 
 
 		 187 aa  91.3  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3093  putative methyltransferase  39.53 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.927458  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1277  putative methyltransferase  35.06 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000114874  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0186  hypothetical protein  36.04 
 
 		 187 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.547416  normal  0.0837793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7999  hypothetical protein  34.36 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.435373  normal  0.241739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0417  putative methyltransferase  43.75 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.591396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3606  hypothetical protein  32.97 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0632  putative methyltransferase  39.52 
 
 		 187 aa  89.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000476134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1983  putative methyltransferase  39.2 
 
 		 185 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1701  methyltransferase, putative  39.2 
 
 		 185 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0255  methyltransferase  42.06 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0617  putative methyltransferase  41.86 
 
 		 186 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0722721 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2465  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  88.6  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2166  putative methyltransferase  37.5 
 
 		 174 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1336  methyltransferase  40.32 
 
 		 184 aa  88.6  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0309  methyltransferase  33.68 
 
 		 204 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2117  methyltransferase  36.17 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.915806  normal  0.649479 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09440  putative methyltransferase  34.62 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.232821 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2470  hypothetical protein  44.27 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.499986  normal  0.0264181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2784  methyltransferase  39.06 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0473702  normal  0.219183 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3037  putative methyltransferase  36.46 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00442708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1172  hypothetical protein  33.67 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701207  normal  0.577502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1274  hypothetical protein  34.95 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1057  hypothetical protein  38.28 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0631575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4970  methyltransferase  40.74 
 
 		 191 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3284  putative methyltransferase  32.8 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1479  putative methyltransferase  42.64 
 
 		 185 aa  86.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.275427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11230  putative methyltransferase  31.6 
 
 		 203 aa  86.3  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.444975  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0208  methyltransferase  33.5 
 
 		 193 aa  85.9  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2991  putative methyltransferase  39.06 
 
 		 185 aa  85.5  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153926  normal  0.592673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3033  putative methyltransferase  39.06 
 
 		 185 aa  85.5  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.70701  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0647  hypothetical protein  41.54 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2509  putative methyltransferase  35.26 
 
 		 192 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0399248  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0683  methyltransferase  32.97 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8024  methyltransferase  41.22 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1990  putative methyltransferase  37.06 
 
 		 175 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03538  putative methyltransferase  40 
 
 		 216 aa  85.1  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1924  putative methyltransferase  37.06 
 
 		 175 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1944  hypothetical protein  37.06 
 
 		 175 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0714  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  85.1  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.162596  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2085  putative methyltransferase  36.29 
 
 		 184 aa  85.1  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2308  putative methyltransferase  32.65 
 
 		 196 aa  85.1  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3437  methyltransferase  32.62 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.312083  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1171  putative methyltransferase  33.14 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0883292  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0643  putative methyltransferase  37.69 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5969  methyltransferase  34.92 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2868  putative methyltransferase  32.47 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1737  putative methyltransferase  27.56 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.575329  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002137  ribosomal RNA small subunit methyltransferase D  32.12 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1639  methyltransferase, putative  37.8 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000207531  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08840  putative methyltransferase  40.8 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1355  methyltransferase  41.09 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0603016  normal  0.270127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2194  hypothetical protein  32.12 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1038  methyltransferase  35.48 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  38.71 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1321  methyltransferase  31.52 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0301345  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1183  putative methyltransferase  32.26 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0816757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0579  methyltransferase  32.81 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330232  normal  0.0174607 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1205  putative methyltransferase  32.26 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000476793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2726  methyltransferase  31.96 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.886986  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3700  methyltransferase  37.9 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0293121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2873  methyltransferase  35.06 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0395  methyltransferase  39.84 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2808  putative methyltransferase  32.12 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.891615  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1892  methyltransferase  41.73 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2323  putative methyltransferase  40.6 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.419537 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2904  hypothetical protein  31.05 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.447797  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf714  N6-adenine-specific methylase  33.06 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>