73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3582 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  41.56 
 
 		 557 aa  169  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  38.89 
 
 		 520 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  38.29 
 
 		 451 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  42.53 
 
 		 658 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  36.53 
 
 		 660 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  40.11 
 
 		 569 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  34.33 
 
 		 481 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  35.5 
 
 		 449 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  34.1 
 
 		 450 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  34.78 
 
 		 1412 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  35.24 
 
 		 1440 aa  82.4  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  36.02 
 
 		 824 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  33.52 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  33.72 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  28.9 
 
 		 313 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  33.52 
 
 		 187 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  36.13 
 
 		 1435 aa  77.4  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  35.33 
 
 		 1449 aa  76.6  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  36.17 
 
 		 1447 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  33.97 
 
 		 1414 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  34.04 
 
 		 1413 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  34.78 
 
 		 1451 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  35.64 
 
 		 1444 aa  73.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  35.02 
 
 		 836 aa  72.4  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  33.87 
 
 		 1459 aa  72  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  40.14 
 
 		 1396 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1425 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  39.44 
 
 		 1448 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  34.03 
 
 		 1458 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  35.86 
 
 		 836 aa  69.3  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  34.57 
 
 		 515 aa  69.3  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  34.39 
 
 		 1440 aa  68.9  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  35.94 
 
 		 1444 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  32.7 
 
 		 548 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  34.97 
 
 		 1421 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  31.58 
 
 		 1455 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  33.51 
 
 		 1439 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  33.51 
 
 		 1439 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  35.64 
 
 		 1440 aa  63.9  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  35.64 
 
 		 1437 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  34.69 
 
 		 1529 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1440 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  31.82 
 
 		 1463 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  31.46 
 
 		 1536 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  32.07 
 
 		 1498 aa  56.2  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  33.33 
 
 		 1459 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2264  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  34.68 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627162 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  35.71 
 
 		 1446 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  35.92 
 
 		 1474 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0540  tRNA(1-methyladenosine) methyltransferase  27.22 
 
 		 356 aa  50.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0936  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  29.17 
 
 		 383 aa  49.3  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1492  methyltransferase small  34.01 
 
 		 207 aa  48.9  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  31.38 
 
 		 684 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  28.57 
 
 		 2123 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  26.14 
 
 		 389 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  23.74 
 
 		 873 aa  46.6  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  24.12 
 
 		 824 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5275  N-6 DNA methylase  24.73 
 
 		 623 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 597 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  34.04 
 
 		 285 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_002620  TC0633  dimethyladenosine transferase  32.32 
 
 		 277 aa  44.7  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1724  dimethyladenosine transferase  35.71 
 
 		 227 aa  43.9  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00275557  hitchhiker  0.0000266565 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3648  N-6 DNA methylase  23.18 
 
 		 529 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  26.21 
 
 		 527 aa  43.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  24.41 
 
 		 860 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2677  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  29.05 
 
 		 296 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1923  ribosomal RNA adenine methylase transferase  35.35 
 
 		 196 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.869968  normal  0.0208059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  31.33 
 
 		 605 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0529  methyltransferase small  30 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1798  hypothetical protein  30.34 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4474  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  29.73 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.135344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12019  methyltransferase  40.28 
 
 		 179 aa  42  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>