47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0441 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  49.01 
 
 		 836 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  53.12 
 
 		 1425 aa  796    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  45.37 
 
 		 1463 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  53.37 
 
 		 1412 aa  789    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  100 
 
 		 824 aa  1662    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  48.7 
 
 		 836 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  88.71 
 
 		 1413 aa  1473    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  43.79 
 
 		 1536 aa  643    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  45.51 
 
 		 1498 aa  633  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  42.72 
 
 		 1529 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  43.83 
 
 		 1440 aa  619  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  45.74 
 
 		 1459 aa  611  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  44.22 
 
 		 1440 aa  596  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  44.25 
 
 		 1451 aa  595  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  44.69 
 
 		 1449 aa  598  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  44.64 
 
 		 1396 aa  595  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  44.88 
 
 		 1444 aa  594  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  44.91 
 
 		 1444 aa  595  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  45.28 
 
 		 1458 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  43.88 
 
 		 1448 aa  588  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  43.21 
 
 		 1435 aa  586  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  44.74 
 
 		 1440 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  43.92 
 
 		 1446 aa  582  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  44.8 
 
 		 1447 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  44.11 
 
 		 1437 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  43.42 
 
 		 1439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  43.42 
 
 		 1439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  42.3 
 
 		 1455 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  43 
 
 		 1440 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  43.38 
 
 		 1474 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  42.84 
 
 		 1459 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  43.33 
 
 		 1414 aa  548  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  43.29 
 
 		 1421 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  37.84 
 
 		 684 aa  313  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  57.6 
 
 		 896 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  33.66 
 
 		 950 aa  224  4e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  32.16 
 
 		 1487 aa  196  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  38.14 
 
 		 515 aa  150  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  44.57 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  36.26 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  31.5 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  27.78 
 
 		 660 aa  57.4  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  31.15 
 
 		 520 aa  55.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  32.65 
 
 		 2123 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  31.97 
 
 		 548 aa  48.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0073  DNA-methyltransferase-like  25.41 
 
 		 313 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.648628 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  28.95 
 
 		 569 aa  45.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>