60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5265 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  45.38 
 
 		 1440 aa  1019    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  61.41 
 
 		 1425 aa  1668    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  43.81 
 
 		 1435 aa  1000    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  43.24 
 
 		 1437 aa  973    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  44.69 
 
 		 1444 aa  1021    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  43.9 
 
 		 1474 aa  991    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  100 
 
 		 1412 aa  2854    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  44.69 
 
 		 1451 aa  1010    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  44.48 
 
 		 1439 aa  1008    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  44.48 
 
 		 1439 aa  1008    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  44.02 
 
 		 1446 aa  1002    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  44.43 
 
 		 1447 aa  987    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  43.56 
 
 		 1421 aa  969    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  44.16 
 
 		 1414 aa  1010    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  44.3 
 
 		 1448 aa  985    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  44.83 
 
 		 1440 aa  1018    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  44.65 
 
 		 1463 aa  1082    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  42.84 
 
 		 1529 aa  1087    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  42.25 
 
 		 1536 aa  1081    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  44.58 
 
 		 1458 aa  988    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  57.33 
 
 		 611 aa  663    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  43.87 
 
 		 1440 aa  1070    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  43.75 
 
 		 1459 aa  1011    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  53.19 
 
 		 824 aa  793    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  44.31 
 
 		 1396 aa  1022    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  43.26 
 
 		 1440 aa  972    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  54.52 
 
 		 1413 aa  1436    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  43.92 
 
 		 1455 aa  998    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  44.16 
 
 		 1459 aa  1002    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  44.23 
 
 		 1449 aa  989    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  43.93 
 
 		 1444 aa  988    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  44.36 
 
 		 1498 aa  1057    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  46.2 
 
 		 896 aa  728    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  48.21 
 
 		 836 aa  607  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  46.56 
 
 		 836 aa  601  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  42.98 
 
 		 623 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  41.78 
 
 		 623 aa  388  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  32.87 
 
 		 950 aa  368  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  40.74 
 
 		 684 aa  325  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  31.02 
 
 		 1487 aa  190  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  40.7 
 
 		 515 aa  151  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  25.65 
 
 		 2123 aa  112  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.78 
 
 		 254 aa  85.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  46.81 
 
 		 397 aa  83.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  20.68 
 
 		 2133 aa  75.1  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  38.85 
 
 		 658 aa  72.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  33.33 
 
 		 569 aa  68.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  33.19 
 
 		 548 aa  58.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  27.35 
 
 		 520 aa  53.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  25.54 
 
 		 557 aa  52.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  23.7 
 
 		 481 aa  48.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  26.92 
 
 		 660 aa  48.5  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  31.54 
 
 		 449 aa  48.5  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  29.86 
 
 		 187 aa  48.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 506 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  23.22 
 
 		 481 aa  46.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  35.58 
 
 		 539 aa  46.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  22.54 
 
 		 484 aa  45.8  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>