48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3850 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  41.89 
 
 
1412 aa  1059    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  91.93 
 
 
1529 aa  2911    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  52.19 
 
 
1463 aa  1507    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  43.37 
 
 
1425 aa  1107    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  53.3 
 
 
1440 aa  1499    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  53.11 
 
 
1435 aa  1497    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  52.12 
 
 
1437 aa  1417    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  53.11 
 
 
1444 aa  1502    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  52.26 
 
 
1474 aa  1449    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  52.2 
 
 
1446 aa  1460    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  52.19 
 
 
1451 aa  1477    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  52.14 
 
 
1448 aa  1453    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  52.61 
 
 
1439 aa  1473    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  52.61 
 
 
1439 aa  1473    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  52.24 
 
 
1440 aa  1471    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  52.24 
 
 
1447 aa  1461    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  42.56 
 
 
1421 aa  1061    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  46.8 
 
 
1414 aa  949    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  52.07 
 
 
1440 aa  1449    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  51.12 
 
 
1459 aa  1448    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  44.39 
 
 
1413 aa  1165    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  53.11 
 
 
1455 aa  1477    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  52.68 
 
 
1459 aa  1465    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  100 
 
 
1536 aa  3173    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  52.05 
 
 
1396 aa  1456    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  54 
 
 
1498 aa  1548    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  56.31 
 
 
896 aa  1003    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  50.21 
 
 
1458 aa  1342    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  52.56 
 
 
1444 aa  1484    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  53.22 
 
 
1449 aa  1488    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  51.32 
 
 
1440 aa  1445    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  43.31 
 
 
824 aa  632  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  44.44 
 
 
836 aa  625  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  43.76 
 
 
836 aa  622  1e-176  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  46.83 
 
 
611 aa  523  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  42.67 
 
 
684 aa  475  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  42.41 
 
 
623 aa  429  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  42.66 
 
 
623 aa  429  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  33.05 
 
 
950 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  40.9 
 
 
515 aa  287  9e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  32.03 
 
 
1487 aa  212  4e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  55.43 
 
 
397 aa  110  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  23.21 
 
 
2123 aa  87.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  21.77 
 
 
2133 aa  70.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  50 
 
 
137 aa  60.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  31.46 
 
 
254 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  35 
 
 
658 aa  47  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  26.67 
 
 
557 aa  45.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>