53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2128 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  92.56 
 
 		 1474 aa  2634    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  76.24 
 
 		 1440 aa  2167    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  57.86 
 
 		 1458 aa  1504    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  46.72 
 
 		 1421 aa  1129    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  43.92 
 
 		 1425 aa  1033    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  75.02 
 
 		 1435 aa  2142    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  69.99 
 
 		 1437 aa  1942    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  52.2 
 
 		 1536 aa  1477    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  76.69 
 
 		 1444 aa  2224    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  47.86 
 
 		 1414 aa  1162    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  43.95 
 
 		 1412 aa  992    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  78.12 
 
 		 1451 aa  2306    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  51.85 
 
 		 1529 aa  1467    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  76 
 
 		 1439 aa  2183    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  76 
 
 		 1439 aa  2183    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  77.15 
 
 		 1440 aa  2211    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  79.87 
 
 		 1447 aa  2286    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  62.89 
 
 		 1498 aa  1795    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  77.67 
 
 		 1440 aa  2217    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  50.38 
 
 		 1440 aa  1356    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  66.57 
 
 		 1459 aa  1864    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  44.77 
 
 		 1413 aa  1053    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  71.8 
 
 		 1455 aa  2071    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  72.7 
 
 		 1459 aa  2102    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  79.74 
 
 		 1448 aa  2266    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  66.5 
 
 		 1396 aa  1841    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  100 
 
 		 1446 aa  2906    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  65.06 
 
 		 896 aa  1143    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  61.8 
 
 		 1463 aa  1744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  75.17 
 
 		 1444 aa  2152    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  77.55 
 
 		 1449 aa  2222    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  46.35 
 
 		 836 aa  606  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  45.92 
 
 		 836 aa  598  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  43.62 
 
 		 824 aa  586  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  52.45 
 
 		 684 aa  556  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  70.4 
 
 		 515 aa  549  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  45.59 
 
 		 611 aa  479  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  44.27 
 
 		 623 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  43.49 
 
 		 623 aa  403  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  35.33 
 
 		 950 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  31.43 
 
 		 1487 aa  191  9e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  65.91 
 
 		 397 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  66.13 
 
 		 137 aa  89  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  28.25 
 
 		 2133 aa  66.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  24.02 
 
 		 2123 aa  65.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  35.71 
 
 		 254 aa  61.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  34.59 
 
 		 187 aa  52.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  34.59 
 
 		 187 aa  52  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  34.59 
 
 		 187 aa  50.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  29.32 
 
 		 557 aa  50.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4206  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 658 aa  50.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000155925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3433  hypothetical protein  71.43 
 
 		 105 aa  45.8  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486333 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  31.43 
 
 		 569 aa  45.1  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>