60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3921 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  43.77 
 
 		 1437 aa  1003    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  43.7 
 
 		 1463 aa  1065    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  43.01 
 
 		 1440 aa  1007    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  43.77 
 
 		 1440 aa  1022    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  44.05 
 
 		 1448 aa  1019    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  44.44 
 
 		 1414 aa  1007    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  43.22 
 
 		 1421 aa  959    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  100 
 
 		 1425 aa  2885    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  44.17 
 
 		 1435 aa  1038    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  44.26 
 
 		 1446 aa  1025    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  43.38 
 
 		 1444 aa  1029    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  44.26 
 
 		 1474 aa  1022    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  61.43 
 
 		 1412 aa  1647    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  44.1 
 
 		 1451 aa  1037    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  44.22 
 
 		 1439 aa  1035    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  44.22 
 
 		 1439 aa  1035    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  45.3 
 
 		 1440 aa  1045    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  45.13 
 
 		 1447 aa  1027    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  42.89 
 
 		 1444 aa  1024    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  42.97 
 
 		 1440 aa  1078    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  44.26 
 
 		 1458 aa  1013    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  44.5 
 
 		 1459 aa  1043    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  54.07 
 
 		 1413 aa  1402    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  43.37 
 
 		 1536 aa  1107    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  43.17 
 
 		 1455 aa  989    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  43.35 
 
 		 1459 aa  1004    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  53.12 
 
 		 824 aa  790    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  44.71 
 
 		 1396 aa  1029    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  43.8 
 
 		 1498 aa  1058    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  45.93 
 
 		 896 aa  737    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  43.3 
 
 		 1529 aa  1105    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  44.41 
 
 		 1449 aa  1029    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  53.74 
 
 		 611 aa  630  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  45.42 
 
 		 836 aa  570  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  45.25 
 
 		 836 aa  570  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  41.64 
 
 		 623 aa  419  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  41.21 
 
 		 623 aa  412  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  30.95 
 
 		 950 aa  381  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  38.97 
 
 		 684 aa  301  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  31.26 
 
 		 1487 aa  194  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  39.86 
 
 		 515 aa  164  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  24.77 
 
 		 2123 aa  101  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  44.79 
 
 		 397 aa  72  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.04 
 
 		 254 aa  71.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3662  hypothetical protein  30.85 
 
 		 569 aa  59.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4362  hypothetical protein  29.57 
 
 		 520 aa  55.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7298  DNA restriction methylase  36.76 
 
 		 548 aa  54.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000885633  unclonable  0.0000166631 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0222  hypothetical protein  27.8 
 
 		 451 aa  52.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.791587 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  32.17 
 
 		 187 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0901  N-6 DNA methylase  24.61 
 
 		 478 aa  49.3  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.741705  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  32.17 
 
 		 187 aa  49.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  31.18 
 
 		 557 aa  48.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  29.77 
 
 		 660 aa  48.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1031  N-6 DNA methylase  23.66 
 
 		 477 aa  48.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11238  normal  0.336468 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  28.34 
 
 		 1328 aa  47.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  30.77 
 
 		 187 aa  46.6  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  25.7 
 
 		 490 aa  47  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  24.73 
 
 		 2133 aa  46.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2095  N-6 DNA methylase  24.72 
 
 		 481 aa  46.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4148  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  33.79 
 
 		 481 aa  45.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.948867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>