50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0108 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  43.79 
 
 
1412 aa  1067    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  51.08 
 
 
1529 aa  1456    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  50.38 
 
 
1463 aa  1387    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  42.93 
 
 
1425 aa  1084    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  50.39 
 
 
1440 aa  1337    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  51.42 
 
 
1435 aa  1389    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  49.05 
 
 
1437 aa  1296    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  50.42 
 
 
1444 aa  1352    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  50.35 
 
 
1474 aa  1325    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  50.42 
 
 
1446 aa  1350    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  49.93 
 
 
1451 aa  1338    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  49.64 
 
 
1439 aa  1326    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  49.64 
 
 
1439 aa  1326    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  51.28 
 
 
1440 aa  1366    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  50.21 
 
 
1447 aa  1332    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  50.57 
 
 
1448 aa  1315    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  43.38 
 
 
1421 aa  1038    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  43.57 
 
 
1414 aa  1053    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  50.61 
 
 
1440 aa  1323    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  50.39 
 
 
1459 aa  1351    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  44.4 
 
 
1413 aa  1098    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  49.12 
 
 
1455 aa  1304    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  49.43 
 
 
1459 aa  1300    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  51.32 
 
 
1536 aa  1452    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  49.64 
 
 
1396 aa  1310    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  48.09 
 
 
1498 aa  1326    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  52.35 
 
 
896 aa  899    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  46.91 
 
 
1458 aa  1207    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  48.7 
 
 
1444 aa  1307    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  48.78 
 
 
1449 aa  1313    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  100 
 
 
1440 aa  2974    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  46.7 
 
 
836 aa  627  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  46.56 
 
 
836 aa  619  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  43.83 
 
 
824 aa  615  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  45.7 
 
 
611 aa  496  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  43.39 
 
 
684 aa  446  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  43.8 
 
 
623 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  43.37 
 
 
623 aa  429  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  35.6 
 
 
950 aa  421  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  42.35 
 
 
515 aa  267  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  31.77 
 
 
1487 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  60.19 
 
 
397 aa  131  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  23.59 
 
 
2123 aa  82  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  52.73 
 
 
137 aa  65.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  31.12 
 
 
254 aa  61.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  30.77 
 
 
187 aa  50.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.546148 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0063  hypothetical protein  30.77 
 
 
187 aa  48.5  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387558  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  29.49 
 
 
187 aa  48.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  25.97 
 
 
557 aa  46.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  27.48 
 
 
660 aa  45.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>